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随机文法模型在RNA二级结构预测中的应用
  • ISSN号:1001-9626
  • 期刊名称:《生物数学学报》
  • 时间:0
  • 分类:TP301.2[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]衡阳师范学院计算机科学系,湖南衡阳421008, [2]衡阳师范学院数学系,湖南衡阳421008, [3]中南大学信息科学与工程学院,湖南长沙410083
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60371046);衡阳师范学院科研基金资助项目(2006B63)
中文摘要:

RNA二级结构的研究是当今计算分子生物学的一个重要课题,基于比较序列分析方法的随机文法模型预测RNA二级结构具有准确率高,能对假结建模,但不易实施等特点,本文通过分析随机文法对RNA二级结构建模的过程,提出了一种综合利用比较序列方法,随机文法方法,词条方法预测RNA二级结构的方案.

英文摘要:

The problem of predicting RNA secondary structures is a hot topic in the current research field of computational molecular biology. Stochastic grammars based on comparative sequence analysis, as a method for predicting RNA secondary structure, have many distinguishing features such as higher precise, Pseudoknot modeling, but hard to implement. So this paper proposed a comprehensive method which employ comparative sequence analysis, stochastic grammars and words dividing method to predict RNA secondary structure.

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期刊信息
  • 《生物数学学报》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国数学会
  • 主办单位:中国数学会生物数学学会
  • 主编:陈兰荪
  • 地址:辽宁省鞍山师范学院158号
  • 邮编:114007
  • 邮箱:smbjbm@tom.com
  • 电话:0412-2960893
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-9626
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1071/O1
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国数学评论(网络版),德国数学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:5686