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完全重瓣型山茶花品种‘红十八学士’CjHTM6基因cDNA的克隆与分析
  • ISSN号:1000-2561
  • 期刊名称:《热带作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江富阳311400, [2]宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江宁波315211
  • 相关基金:林业公益性行业科研专项(200704028); 林业“948”项目(2007-4-04); 浙江省国际合作重大项目(2008C14066); 浙江省院合作林业科技项目(2008SY008)
中文摘要:

为研究山茶重瓣性状形成分子机理,采用RACE技术从完全重瓣型山茶花品种‘红十八学士’中克隆TM6基因全长cDNA,再利用生物信息学和Real-time PCR技术对其进行分析。结果表明:该基因cDNA全长729 bp,命名为CjHTM6,有一个完整的开放阅读框(627 bp),编码208个氨基酸,蛋白质分子量24.31 ku,理论等电点为9.53,不稳定系数达44.07;编码蛋白为MADS-box蛋白,其预测的二级结构和三级结构主要以α-螺旋为主,其次为无规卷曲,延伸链所占比重最小;与单瓣花型短柄山茶至少有4个氨基酸差异。定量分析结果表明,CjHTM6基因在花中各部均有表达,其中在花心的花瓣中表达量最高,而在苞片中表达量最低。初步表明,CjHTM6基因在山茶重瓣花形成中起重要作用。

英文摘要:

To study the molecular mechanism of double flowers,TM6(TOMATO MADS BOX GENE6)gene cDNA named as CjHTM6 was cloned from Camellia japonica'Hongshibaxueshi',and the full length was amplified by RACE(Rapid amplification of cDNA end)method and analyzed by bioinformatics.These results showed that CjHTM6 cDNA sequence length was 729 bp and it included a completed open reading frame(ORF)encoding 208 amino acids.The molecular weight of the protein by CjHTM6 gene was 2.34 kD,and the iso-electric point was 9.53,and the instability index was 44.07.The coding protein belonged to the MADS-box with mainly alpha-helix,followed by random coil and few extend strand in its tertiary or secondary structure.The amino acids sequence had four differences with Camellia japonica subs.rusticana.The expression results showed that it expressed at every flower parts,but the highest was at central petals,and the lowest was at bracts.The CjHTM6 gene may be involved in formal double thigmomorphogenesis in Camellia.

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期刊信息
  • 《热带作物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国热带作物学会
  • 主编:郭安平
  • 地址:海南省海口市龙华区学院路4号
  • 邮编:571101
  • 邮箱:rdzx136@163.com
  • 电话:0898-66963858 0898-66989992
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2561
  • 国内统一刊号:ISSN:46-1019/S
  • 邮发代号:84-29
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊三等奖,海南省优秀科技期刊奖及全国高校自然科学优秀学报...,全国农业学会第二届优秀期刊奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:14025