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NIDD基因TaqMan探针的制备及其在实时荧光定量PCR方法中的应用
  • ISSN号:1671-7783
  • 期刊名称:《江苏大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R446.61[医药卫生—诊断学;医药卫生—临床医学] R338.1[医药卫生—人体生理学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]南通大学基础医学院微生物与免疫学教研室,江苏南通226001, [2]南通大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,江苏南通226001
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30300099);江苏省自然科学基金(Bg2003035);江苏省高校自然科学研究基金(03KJBl80109);江苏省社会发展科技指导性计划项目(BS2004526).
中文摘要:

目的:制备NIDD基因TaqMan探针建立检测NIDD基因荧光定量PCR(FQ-PCR),以进一步研究NIDD的表达情况。方法:采用RT-PCR法,从出生后一天的SD大鼠脑组织mRNA中扩增NIDD基因的部分编码序列区(CDS)片段,克隆入pGEM-T载体,筛选阳性克隆、酶切鉴定及序列测定。采用TaqMan探针,以重组质粒为模板绘制标准曲线。结果:RT—PCR法扩增出一特异产物与预期长度112bp相符,DNA序列测序的结果与C,eneBank提供的已知序列(AB098078)比较,所克隆的NIDD基因片段与其中的112bp完全相同,与NIDD基因100%同源。以重组质粒为模板绘制标准曲线,相关系数r大于0.99,反应效率显示为1,各点变异系数小于10%。结论:采用RT.PCR和T载体技术成功制备出可应用于FQ-PCR的NIDD基因TaqMan探针。

英文摘要:

Objective: To obtain the probe of a novel nNOS-interacting DHHC domain-containing protein with dendritic mRNA (NIDD) for real-time fluorescent quantitative PCR (FQ-PCR). Methods: The partial CDS of NIDD was amplified by RT-PCR from ld postnatal SD rat brain. RT-PCR product was ligated into pGEM-T vector, and the DNA sequence was detected. The standard curve was drawn with the recombinant plasmids and the NIDD TaqMan probe. Results: The product of RT-PCR was 112 bp which matched the size of the purpose. This DNA sequence was 100% homogeneous with the NIDD cDNA reported. The correlation coefficient of the standard curve was above 0.99, the reaction efficiency was 1 and all the variation coefficients were below 10%. Conclusion: The NIDD TaqMan probe for FQ-PCR has been successfully obtained with RT-PCR and T vector techniques.

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期刊信息
  • 《江苏大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:江苏省教育厅
  • 主办单位:江苏大学
  • 主编:许化溪
  • 地址:江苏省镇江市梦溪园巷30号
  • 邮编:212003
  • 邮箱:
  • 电话:0511-84446824
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7783
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1669/R
  • 邮发代号:28-192
  • 获奖情况:
  • 1995年、1999年被评为江苏省优秀学报
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:6001