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Identification of three novel noncoding RNAs from Drosophila melanogaster
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q52[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education, State Key Laboratory for Biocontrol, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510275, China
  • 相关基金:We would like to thank Chen Xiaohong for her technical assistance. This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 30230200), the Ministry of Education of China and Guangdong Province (Grant No. IRT0447, NSF-05200303) and the National Basic Research Program (Grant No. 2005CB724600).
中文摘要:

三新奇小非编码的 RNA 从 D 的保存 intronicregions 被识别。由使用比较基因组学方法和分子的生物学途径的 melanogaster。Oneis 以一个 combinated 方法的新奇 snoRNA,它 snoRNAfamily 显示典型地代表 C/D 盒子的结构的特征并且为在 C2673 指导 D.melanogaster 28S rRNA 的 2''-O-methylation 拥有一个 10-nt-long rRNA 反感觉元素。另外的二是预言先锋采用已知的 miRNA 的 astem 环结构特征的 miRNAs。二 miRNAs 基因看起来有无所不在的表示侧面, ~ 23-nt RNA 抄本由北弄污检测了。我们的学习 revealed396 多种类 intronic 保存了与长度 from100 在 introns 嵌套到 500 bp 的序列(MCIS ) 。除了编码的小 RNA, MCIS 可能作为涉及基因抄写或 post-transcriptional 处理的 c/s-acting 元素工作。

英文摘要:

Three novel small noncoding RNAs were identified from the conserved intronic regions of D. melanogaster by using comparative genomics method and molecular biology approach. One is a novel snoRNA in a combinated way, which displays structural features typical of C/D box snoRNA family and possesses a 10-nt-long rRNA antisense element for guiding the 2'.-O-methylation of the D. melanogaster 28S rRNA at C2673. The other two are miRNAs whose predicted precursors adopt a stemloop structure characteristic of known miRNA. The two miRNAs genes appear to have ubiquitous ex- pression profiles with -23-nt RNA transcripts detected by Northern blotting. Our study revealed 396 multi-species intronic conserved sequences (MCIS) that nested in the introns with a length from 100 to 500 bp. In addition to small RNA coding, the MCIS might function as cis-acting elements involved in gene transcription or post-transcriptional processing.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851