通过比较基因组和分子生物学方法分析了果蝇属中5种果蝇全基因组内含子区域的保守序列,获得了3个新的非编码RNA基因.其中一个为具有典型的box C/D家族保守元件及结构特征的核仁小分子RNA基因,其功能序列可介导28S rRNA的C2673位点的核糖甲基化修饰.另外两个为miRNA基因,其转录序列可形成典型的miRNA前体茎环结构:在果蝇发育的4个时期均可表达产生长度为23个核苷酸的成熟RNA分子.结果还表明,在长度为100—500bp区间的黑腹果蝇基因内含子中存在396个多物种保守序列(MCIS),这些序列除编码小分子RNA外,还可能与影响基因转录或转录后加工的顺式元件有关.