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多批次肝衰竭患者呼出气体的电喷雾萃取电离质谱检测及代谢组学数据分析
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O657.6[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]东华理工大学江西省质谱科学与仪器重点实验室,南昌330013, [2]东华理工大学信息工程学院,南昌330013, [3]南昌大学第一附属医院,南昌330123
  • 相关基金:江西省重大科技创新研究项目(批准号:20124ACB00700); 长江学者和创新团队发展计划项目(批准号:IRT13054); 国家自然科学基金(批准号:21265002)资助
中文摘要:

采用高分辨电喷雾萃取电离质谱(EESI-MS)技术对肝衰竭患者和健康志愿者呼出气体样本进行快速检测,结合多块偏最小二乘分析(MB-PLS)方法,对多批次获取的呼出气体代谢数据进行统计建模分析,并与传统的PLS方法进行比较.结果表明,MB-PLS方法能有效消除批次差异对统计建模的影响.此外,利用MB-PLS模型变量VIP值对变量进行筛选,可降低数据的冗余,消除无关变量对模型的影响,从而有效提高了模型的性能.

英文摘要:

In metabolomics studies,the number of samples should be enough to guarantee the reliability of data statistical analysis. The effective storage time of exhaled breath is short,and it is difficult to collect and detect a large number of breath samples in a short time. Combining multi batches of samples may obtain a large data,but usually there is a large variance between batches induced by ambient air varying. In this paper,the exhaled breath data of liver failure patients and healthy volunteers were obtained by high resolution extractive electrospray ionization mass spectrometry( EESI-MS) and then analyzed by multi-block partial least square( MB-PLS). The results were compared with traditional PLS method and showed its strength of removing the variance of batches for modeling. Moreover,we provided a variable selection strategy that based on variable importance in the projection( VIP) of MB-PLS to reduce the redundancy of data and eliminate the effect of non-information variables for modeling,and the performance of MB-PLS model had a great improvement.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676