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小鼠α-synuclein 基因内含子1甲基化定量检测方法的建立及不同脑区甲基化水平的比较研究
  • ISSN号:1671-7856
  • 期刊名称:《中国比较医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R33[医药卫生—人体生理学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]首都医科大学宣武医院药物研究室,神经变性病教育部重点实验室,北京 100053
  • 相关基金:国家自然科学基金(编号81274120);北京市自然科学基金(编号7132110);北京市新世纪百千万人才工程项目(编号008-0014)。
中文摘要:

目的:建立一种定量检测小鼠α-突触核蛋白基因(α-syn)内含子1甲基化水平的方法,分析不同脑区该区域甲基化水平的差异。方法使用MSPPrimer确定小鼠α-syn内含子1的CpG 岛区域。使用PyroMark assay design 2.0针对该CpG岛设计焦磷酸扩增及测序引物。采用焦磷酸测序法分析成年小鼠海马、皮质、纹状体及中脑四个脑区该区域甲基化水平。结果小鼠α-syn内含子1存在CpG岛。成功优化定量该CpG岛甲基化水平的焦磷酸测序方法。焦磷酸测序表明各脑区该区域甲基化均低于2%。结论建立了定量检测小鼠α-syn基因内含子1CpG岛甲基化水平的方法。该CpG岛甲基化对于成年小鼠各脑区中α-syn的表达不起主要调控作用。

英文摘要:

Objective To establish a quantitative method to examine the methylation level of CpG island located in the intron 1 of mouse α-synuclein, and analyze the difference of methylation in various brain regions .Methods CpG island in the intron 1 of mouse α-synuclein was identified using an online software MSPprimer .Pyrosequencing assay was designed using PyroMark assay design 2.0.DNA methylation was quantified in mouse hippocampus , cortex, striatum and midbrain using pyrosequencing assay .Results There was a CpG island in the intron 1 of mouse α-synuclein. Pyrosequencing assay measuring methylation level of this CpG island was optimized .It indicated that all of the brain regions were hypomethylated with a methylation rate of 2%or less.Conclusion DNA methylation does not play a major role in the transcription regulation of mouse α-synuclein in the brain .

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期刊信息
  • 《中国比较医学杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国实验动物学会 中国医学科学院医学实验动物研究所
  • 主编:秦川
  • 地址:北京市朝阳区潘家园南里5号
  • 邮编:100021
  • 邮箱:b67761337@126.com
  • 电话:010-67779337
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7856
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4822/R
  • 邮发代号:82-917
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7696