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洋桔梗品种遗传多样性的AFLP分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:2014.7.15
  • 页码:1325-1330
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南京师范大学生命科学学院/江苏省生物多样性与生物技术重点实验室,南京210023
  • 相关基金:国家基础科学人才培养基金(J1103507)
  • 相关项目:科研训练及科研能力提高项目
中文摘要:

该研究以洋桔梗(Eustoma grandi florum)2个品种‘玛丽艾基粉色’和‘圣剑白底紫边’为试材,提取叶片DNA,经过EcoRI /Mse Ⅰ双酶切、连接、预扩增、选择性扩增,建立了洋桔梗的AFLP最佳反应体系;并以64个常用引物组合进行扩增,得到154个多态性条带,从中筛选出扩增条带较多且多态性较好的4个引物组合(E-ACA/M-CTC,E-ACC/M-CAC,E-AGC/M-CTT,E-ACT/M-CAG),其多态位点百分率均值为24.36%.利用上述4个引物组合,以最佳反应体系为基础,构建了7个常见洋桔梗品种的AFLP指纹图谱,统计7个品种各4个引物组合在1 000~300 bp区间7个区段的扩增条带,并将各个品种的AFLP指纹图谱转换成各品种4组7位数构成的28位特异数字指纹,极大地方便了种质比较及鉴定;7个品种间的遗传相似系数介于0.683 5~0.860 8之间,平均值为0.774 6.研究结果为进一步进行洋桔梗的种质研究及利用奠定了基础.

英文摘要:

Taking Eustoma grandiflorum cultivars ‘Double Mariachi Pink’ and ‘Excalibur Blue Picotee’ as experimental material,we extracted genomic DNA from the leaves.The optimized AFLP reaction system was established,after EcoR Ⅰ/Mse Ⅰ double enzyme digestion,ligation,pre amplification and selective am plification.154 polymorphic bands were acquired with 64 primer combinations commonly used,from which 4 selective amplification primer combinations (E-ACA/M-CTC,E-ACC/M-CAC,E-AGC/M-CTT,E-ACT/ M-CAG) with more polymorphic amplified bands were selected.The average percentage of polymorphic bands was 24.36 %.Using the 4 selective amplification primer combinations,through the optimized reaction system,the AFLP fingerprints of 7 common E.grandiflorum cultivars were constructed.Subsequently,the AFLP fingerprints were transformed into the specific digital fingerprints of 28 digits,based on the counting of the amplified bands in the 7 sections of 1 000~300 bp interval of the 4 primer combinations,greatly fa cilitating the comparison and identification of the germplasm.The genetic similarity coefficient between the cultivars ranged 0.683 5~0.860 8,and the average value was 0.774 6.The results of that study have laid an important foundation for the further research on E.grandiflorum.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104