位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
粳稻穗角性状优异等位变异的挖掘
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:《中国水稻科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q943.2[生物学—植物学] S511.03[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京210095, [2]上海市农业科学院,上海201403
  • 相关基金:教育部科技基础条件平台重点资助项目(505005); 国家863计划资助项目(2010AA101301); 教育部博士点基金资助项目(B0201100690)
中文摘要:

为了发掘控制粳稻穗角性状的优异等位变异和携带优异等位变异的载体材料,利用151个SSR标记对95份粳稻品种构成的自然群体进行了基因型鉴定,分析了SSR标记位点间连锁不平衡程度和群体结构,并采用TASSEL软件的一般线性模型对穗角性状与标记变异进行了关联分析。结果表明,151个标记的11 325种位点组合中,无论是共线还是非共线组合,都有一定程度的连锁不平衡存在,育成品种的连锁不平衡程度高于地方品种;自然群体由6个亚群组成;检测到了15个与穗角性状相关联的SSR标记,分布于除第4和第7以外的其余10条染色体上,其中,RM7598、RM3700、RM311和RM1125具有较大的表型变异解释率;并鉴定出23个控制穗角性状的优异等位变异以及7个携带这些优异等位变异的典型载体材料,其中,秀水04和秀水79携有较多的优异等位变异。

英文摘要:

In order to mine elite alleles of panicle angle trait and their carrier varieties in japonica rice,association analysis between SSR loci and panicle angle trait was performed by using genotyping data of 151 SSR markers on a natural population composed of 95 japonica varieties(58 landraces and 37 cultivars) with the general linear model in software of TASSEL.Linkage disequilibrium and population structure were firstly analyzed for the population.Linkage disequilibrium at different levels was detected not only among syntenic markers but also among nonsyntenic ones.The cultivar population had a higher level of linkage disequilibrium than that of the landrace population.Genetic structure analysis showed that the natural population was composed of 6 subpopulations.Fifteen SSR loci associated with the trait were detected and located on 10 chromosomes except chromosomes 4 and 7.The markers RM7598,RM3700,RM311 and RM1125 each could explain more than 10% of phenotypic variation.Twenty-three elite alleles and their typical carrier materials were further screened out.Of the seven typical carrier materials,Xiushui 04 and Xiushui 79 carried more elite alleles.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826