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衣原体噬菌体Chp3衣壳蛋白Vp1二级结构及B细胞抗原表位预测
  • ISSN号:1672-0709
  • 期刊名称:《中国中西医结合皮肤性病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R751.05[医药卫生—皮肤病学与性病学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]天津医科大学总医院皮肤科,天津300052
  • 相关基金:基金项目国家自然科学基金资助项目(30671879)
中文摘要:

目的:预测衣原体噬菌体Chp3Vp1蛋白的二级结构和B细胞表位。方法:以Chp3Vp1氨基酸序列为基础,采用Gamier-Robson法、Chou—Fasman法和Karplus-Schulz法预测蛋白二级结构;按Kyte—Doolittle法、Hopp—Woods法、Emini法和Jameson-Wolf法预测蛋白的抗原表位。结果:Chp3Vp1蛋白含多个抗原位点,预测其N端1—10,101—112,159—166,174—184,189—195,288—299,323—333,419-435,477-490为优势表位。结论:Chp3Vp1蛋白有较强的免疫原性,预测的抗原位点为之后蛋白相互作用研究和单抗制备提供了理论依据。

英文摘要:

Objective: To predict the secondary structure and B cell epitope of capsid protein Vp1 from Chlamydiaphage Chp3. Methods: The secondary structure was predicted by the method of GamierRobson, Chou-Fasman and Karplus-Schulz, and its cell epitope was predicted by the method of Kyte- Doolittle,Hopp-Woods,Emini and Jameson-Wolf. Results: The sections of 1-10,101-112, 159- 166,174-184,189-195,288-299,323-333, 419-435 and 477-490 in the N terminal of Chp3Vp1 protein could be the epitope of B cell. Conclusion: Chp3Vp1 protein has strong immumogenicity.The research provides the basis for the preparation of monoclonal antibody and the reference for the discussion for the molecular regulation mechanism of protein to protein.

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期刊信息
  • 《中国中西医结合皮肤性病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国中西医结合学会 天津市中西结合皮肤病研究所
  • 主编:温海
  • 地址:天津市红桥区北马路354号
  • 邮编:300120
  • 邮箱:chzhbjb01@163.com
  • 电话:022-27283090
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-0709
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1380/R
  • 邮发代号:6-172
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:6307