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欧美山杨杂种插穗不定根2个发育时期基因表达谱分析
  • ISSN号:1000-1522
  • 期刊名称:《北京林业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S718.43[农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]东北林业大学生命科学学院,150040, [2]黑龙江省农业科学院园艺分院
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(J1210053); 中央高校基本科研业务费专项(2572014CA22)
中文摘要:

以欧美杂种山杨嫩枝插穗为实验材料,进行扦插不定根生成过程中插穗形态和解剖学观察,通过Solexa高通量测序对扦插后6和12 d插穗不定根生成部位进行转录水平上的检测分析。插穗解剖观察发现扦插后6 d为根原基的诱导期,12 d为不定根的伸长生长期,对插穗不定根2个时期高通量测序获得差异表达基因2 328个。对筛选出的显著差异表达基因进行功能注释、分类和KEGG及pathway分析,确定2个山杨样本中差异表达基因参与的生化代谢和信号转导途径。

英文摘要:

We used Populus tremula × P. tremuloides softwood cuttings as experimental material, and observed morphological and anatomical changes of the cuttings during the rooting process of adventitious roots. Solexa high-throughput sequencing was performed for the parts of cuttings where adventitious roots generated 6 days and 12 days after cutting( DAC) at transcriptional level. Anatomical observation showed that the induction stage of the adventitious root primordia was 6 days after cutting and the elongation stage of adventitious roots was 12 days after cutting. A total of 2 328 differentially expressed genes were obtained by the Solexa high-throughput sequencing. The significantly differential expression genes were classified after their functions annotation,and then the KEGG passway analysis was carried out. On this basis,the biochemical metabolic and signal transduction pathways of these differentially expressed genes were determined.

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期刊信息
  • 《北京林业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:北京林业大学
  • 主编:尹伟伦
  • 地址:北京市海淀区清华东路35号
  • 邮编:100083
  • 邮箱:bldxeb@bjfu.edu.cn
  • 电话:010-62337673
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1522
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1932/S
  • 邮发代号:82-304
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30004