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EGFR基因非翻译区单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性之间的关系
  • ISSN号:1000-7431
  • 期刊名称:肿瘤
  • 时间:2013.4.4
  • 页码:321-326
  • 分类:R735.2[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]南京中医药大学基础医学院病原与免疫学教研室,江苏南京210023, [2]南京中医药大学中西医结合学科,江苏南京210023, [3]江苏省中医院检验科,江苏南京210029, [4]江苏省中医院消化肿瘤外科,江苏南京210029, [5]江苏省人民医院检验科,江苏南京210029, [6]中国人民解放军第八一医院检验科,江苏南京210002
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(编号:30973715,81001502);江苏省自然科学基金资助项目(编号:BK2008461);教育部高等学校博士学科点专项科研基金(编号:20103237110011);江苏高校优势学科建设工程基金资助项目(PAPD);江苏省高校自然科学研究项目(编号:10KJB360004);南京中医药大学优秀中青年教师支持计划
  • 相关项目:EGF和TGF-α参与舌苔形成的信号转导机制研究
中文摘要:

目的:分析表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因非翻译区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与江苏省胃癌患者遗传易感性之间的关系。方法:收集387例胃癌患者和392例健康体检者(正常对照)的外周血,采用聚合酶链式反应-连接酶检测反应检测EGFR基因非翻译区rs6965469、rs884225、rs884904和rs763317等4个SNPs位点,分析其与胃癌遗传易感性之间的关系。结果:EGFR基因非翻译区rs6965469、rs884225、rs884904和rs763317的等位基因在胃癌组和健康对照组间的分布差异无统计学意义(P〉0.05)。rs6965469TC基因型在胃癌组和正常对照组间的分布差异有统计学意义(P〈0.05)。由rs6965469、rs884225和rs884904构建的单倍型TGA可显著增加胃癌的患病风险[比值比(oddsratio,OR)=3.52,95%置信区间(condence interval,CI)=2.34~5.29],而单倍型TAG则显著降低胃癌的患病风险(OR=0.41,95%CI=0.26~0.64)。结论:EGFR基因非翻译区T等位基因可能是胃癌发生的风险因素,联合检测rs6965469、rs884225和rs884904的SNPs有助于评估江苏地区胃癌的遗传易感性。

英文摘要:

Objective: This population-based study is aimed to investigate the association of SNP (single nucleotide polymorphism) in untranslated region of EGFR (epidermal growth factor receptor) gene with genetic susceptibility of gastric cancer in Jiangsu province, China. Methods: The peripheral blood samples from 387 patients with gastric cancer and 392 healthy volunteers (as normal controls) were collected. Four SNPs including rs6965469, rs884225, rs884904 and rs763317 in untranslated region of EGFR gene were detected by polymerase chain reaction-ligase detection reaction assay. The associations of these SNPs with the genetic susceptibility of gastric cancer were evaluated. Results: The SNP allele frequencies of rs6965469, rs884225, rs884904 and rs763317 were not significantly different between the patients with gastric cancer and the normal controls (P 〉 0.05). The frequency of genotype rs6965469 TC was significantly different between the patients with gastric cancer and the normal controls (P 〈 0.05). The haplotype TGA (rs6965469, rs884225 and rs884904) was associated with a significant increase in risk for gastric cancer [OR (odds ratio) = 3.52, 95% CI (confidence interval): 2.34-5.29] while the haplotype TAG was associated with a significant decrease in risk for gastric cancer (OR = 0.41, 95% CI: 0.26-0.64). Conclusion: The T allele polymorphism in untranslated region of EGFR gene may be associated with the genetic susceptibility of gastric cancer. Combined analysis of SNPs including rs6965469, rs884225 and rs884904 may be useful to predict the risk of gastric cancer in Jiangsu province, China.

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期刊信息
  • 《肿瘤》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:上海市肿瘤研究所
  • 主编:高玉堂
  • 地址:上海斜土路2200弄25号
  • 邮编:200032
  • 邮箱:tumorsci@yahoo.com.cn
  • 电话:021-64436792
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7431
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1372/R
  • 邮发代号:4-289
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,中国科技论文统计源核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19202