位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
一种仿生的面向可重构多细胞阵列的分布式定序方法
  • ISSN号:1000-1220
  • 期刊名称:《小型微型计算机系统》
  • 时间:0
  • 分类:TP302[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]国防科学技术大学计算机学院,长沙410073, [2]中国人民解放军沈阳军区总医院,沈阳110016
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(60833004)资助;国家“八六三”高技术研究发展计划重点基金项目(2008AA01A201)资助.
中文摘要:

提出一种仿生的面向多细胞阵列的分布式定序方法.该方法是基于生物学上的图式形成理论,通过催化剂-抑制剂模型在多细胞阵列中建立浓度梯度,并在此基础上进行定序.该方法具有如下的特点:跟现有的多细胞阵列维序方法相比,它采用主动的维序方式;跟传统的分布式定序方法相比,它不需要初始特征值就能实现定序和维序.故障注入实验表明,该定序方法较现有的方法具有更强的鲁棒性,在细胞出错的情况下能够重新建立浓度梯度和重新定序.此外,我们在Xilinx公司的型号为Virtex-6 XC6 VLX760的FPGA芯片上实现了5×5多细胞阵列,对浓度梯度建立和重建时间及硬件资源开销进行了评估.

英文摘要:

A bio-inspired distributed ranking approach for reconfigurable multicellular array architecture is presented in this paper. It is based on the pattern formation theory in biology. We first set up the morphogen gradient through the activator-inhibitor model, and then propose the distributed ranking method based on this. Our method has two characteristics: first, it's an active cell ranking and sequence number maintaining method compared to existing passive cell sequence number maintaining methods in multicellular array architectures; second, it doesn't need initial value to rank and maintain cell sequence numbers, which is different from ordinary distributed ranking methods. The results of fault-injection experiments show our method has better robustness than existing methods, that is, when cells die, concentration gradient is re-established and a new ranking process is started. We also implemented the 5×5 cellular army with a Xilinx Virtex-6 XC6VLX760 FPGA, and has evaluated the gradient establish or re-establish time, as well as the hardware cost.

同期刊论文项目
期刊论文 75 会议论文 63 专利 12
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《小型微型计算机系统》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院沈阳计算技术研究所
  • 主编:林浒
  • 地址:沈阳市浑南新区南屏东路16号
  • 邮编:110168
  • 邮箱:xwjxt@sict.ac.cn
  • 电话:024-24696120 024-24696190-8870
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1220
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1106/TP
  • 邮发代号:8-108
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23212