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应用基因芯片检测中国野生葡萄抗白粉病基因表达
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:园艺学报
  • 时间:0
  • 页码:1053-1058
  • 语言:中文
  • 分类:S663.1[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学园艺学院、农业部西北园艺植物种质资源与遗传改良重点开放实验室,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家转基因植物研究和产业化专项(JY03-A-19-02);国家自然科学基金项目(30571280)
  • 相关项目:中国野葡萄抗白粉病新基因的表达与功能分析
中文摘要:

研究了利用Affymetrix的欧洲葡萄基因表达芯片检测中国野生葡萄基因表达的可行性,并检测了葡萄白粉病菌(Uncinular necator)人工接种诱导48h后的基因表达情况。结果表明:该芯片可以在感病材料中检测出表达的基因11906个,抗病材料中检测到表达的基因11839个,在二者中同时检出表达的基因11839个,能够检出的基因数占该芯片基因探针组总数的71.3%,因此用欧洲葡萄基因芯片检测中国野生葡萄中基因表达水平是可行的;利用此芯片检测出在人工接种诱导后,抗病材料中和感病材料相比表达上调的基因共1920个,占检测出基因总数的16.21%;表达下调的基因数1760个,占检测出基因总数的14.87%;表达上调和下调的幅度(signal log ratio)都在1—7倍之间。

英文摘要:

The feasibility of using Affymetrix Vitis vinifera gene expression microarray to detect the gene expression of Chinese wild grape was studied, and the gene expression after 48 h artificial inoculation with Uncinular necator was detected. The results showed that the microarray can detect the expression of 11 906 genes in susceptible material (S), while 11 839 genes in resistant individual (R) and 11 839 genes in both R and S. The detected genes accounted for 71.3% of the total 16 602 probe groups. That means Affymetrix V. vinifera microarray can be efficiently used for gene expression analysis of Chinese wild grapes. Compared to the S plant, 1 920 up-regulated and 1 760 down-regulated genes were detected in R plant, accounting for 16.21% and 14. 87% of total detected genes respectively, up-and down-regulated rate (signal log ratio) are among 1 to 7.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371