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华东葡萄白河-35-1株系抗霜霉病基因cDNA文库构建及EST分析
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学园艺学院,农业部西北园艺植物种质资源与遗传改良重点开放实验室,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌712100
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(No.30571280和No.30771493)资助.
中文摘要:

以中国原产抗霜霉病葡萄野生种华东葡萄(Vitis pseudoreticulata)白河-35-1为材料,用SMART^TM技术构建葡萄霜霉菌(Plasmopara viticola)诱导的葡萄叶片cDNA文库。经检测,原始文库滴度0.92×10^6pfu/mL,重组率97%,插入片段500~2200bp,扩增文库滴度为5×10^9pfu/mL。随机挑取克隆5’端测序,获得254条有效EST序列(GenBank登录号:FG269201-FG269449和FG396006-FG396010o经BlastX分析,有56.3%ESTs与GenBank中功能已知基因有较高同源性,14.6%ESTs与功能尚未确定的假设蛋白或未知蛋白同源性很高,20.9%ESTs在GenBank中无匹配的同源产物。

英文摘要:

A cDNA library was constructed with Vitis pscudoreticulata clone Baihe-35-1 leaves inoculated by Plasmopara viticola using SMART^TM cDNA Library Construction Kit. The titer of primary library and amplified library was about 0.92× 10^6 pfu/mL and 5× 10^9 pfu/mL, respectively. In the primary library, 97% clones were recombinant and the length of insert cDNAs were from 500 to 2 200 bp. Two hundred and fifty-four ESTs (GenBank accession No. FG269201-FG269449 and FG396006-FG396010) were obtained by random sequencing of the cDNA library. BlastX search showed that 56.3% ESTs had higher homology with functional genes, 14.6% ESTs with hypothetical putative or unknown protein, and 20.9% ESTs had no-hits.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081