位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
检测葡萄抗黑痘病基因DNA探针的合成及应用
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S663.101[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]农业部西北园艺植物种质资源利用重点开放实验室,杨凌712100;陕西省农业分子生物学实验室,杨凌712100, [2]陕西省农业分子生物学实验室,杨凌712100, [3]西北农林科技大学园艺学院杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30170653和No.30571280)资助
中文摘要:

依据中国野生葡萄(Vitis pseudoreticulata)抗黑痘病(Sphaceloma ampelinum)基因RAPD标记OPS03-1354的全长序列,设计合成了两个寡聚核苷酸R1(5'-CAGAGGTCCCTAGCTAAT-3)'和R2(5'-ACA ATCACCCAACTCCTC-3)'作为引物。首先对获得该RAPD标记的种间杂交组合白河-35-1(V.pseudoret-iculata clone Baihe-35-1)×佳利酿(V.vinifera cv.Carignane)亲本及其F251株进行PCR分析,其中寡聚核苷酸R2能在抗黑痘病植株中扩增出约1100bp的DNA片段。进一步用R2对另一种间杂交组合广西-1(V.pseudoreticulata clone Guangxi-1)×京可晶(V.vinifera cv.Jingkejing)F1339株进行PCR检测,R2能在抗病植株中扩增出约1100bp的DNA片段。最后用R2对48份葡萄资源包括中国野生葡萄、美国野生葡萄和欧洲葡萄进行了PCR检测,在抗病株系和品种中也能扩增出这一片段。结果表明,获得的约1100bp特异片段为葡萄抗黑痘病基因的序列特异性扩增区(SCAR)标记,凡扩增出该SCAR标记的植株即是抗黑痘病基因的携带者和抗黑痘病性状的表达者。将该SCAR标记克隆与测序,其实际长度为1110bp,命名为SCS03-1110。获得该SCAR标记的18bp寡聚核苷酸R2(5'-ACAATCACCCAACTCCTC-3)'具有检测葡萄抗黑痘病基因的DNA探针作用。

英文摘要:

Based on the sequence of RAPD marker OPS03-1354 linked to anthracnose(Sphaceloma ampelinum) resistance gene,two oligomers,R1(5'-CAGAGGTCCCTAGCTAAT-3') and R2(5'-ACAATCACCCAACTC CTC-3'),were designed and synthesized,and used as special primer for PCR analysis among the parents and 51 F1 individuals from interspecific cross combination Vitis pseudoreticulata Baihe-35-1×V.vinifera Carignane.A DNA band about 1 100 bp could be amplified among resistant plants using primerR2,and was present in resistant plants of 339 F1 individuals from interspecific cross combination Guangxi-1(V.pseudoreticulata)×Jingkejing(V.vinifera) and of 47 lines(varieties) of grape resources,including Chinese wild Vitis,American wild Vitis and European grape,by PCR analysis.The result showed that the DNA band about 1 100 bp was a sequence-characterized amplified region(SCAR) markerlinked to anthracnose-resistance gene in grape.The plants with the SCAR marker were the carrierand expression of anthracnose-resistance gene.Cloning and sequencing of the SCAR marker were carried out.The length of the SCAR marker was actually 1 110 bp and it was named SCS03-1110.This research reveals that the oligomer R2(5'-ACAATCACCCAACTCCTC-3') as a DNA probe can be used to identify anthracnose-resistance gene of grape germplasm resources and hybrids from anthracnose-resistance breeding program by PCR assay.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081