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华东葡萄抗白粉病杂种后代cDNA文库的构建及EST序列分析
  • ISSN号:1009-9980
  • 期刊名称:《果树学报》
  • 时间:0
  • 分类:S663.1[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]农业部西北园艺植物种质资源利用重点开放实验室,陕西省农业分子生物学重点实验室,西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30571280&No.30771493);农业部公益性行业科研专项200803038
中文摘要:

以抗白粉病的华东葡萄杂种后代6-12-4株系为试材,利用SMARTTM技术构建了白粉病病原菌诱导的全长cDNA文库。经检测,原始文库滴度为2.50×106pfu·mL^-1,重组率达到99%,扩增文库滴度为3.0×109pfu·mL^-1,重组率达到95%,插入片段长度在500~2000bp。随机挑取300个克隆,测序获得260条质量较高的ESTs,聚类及拼接后,共得到183个一致序列(所获序列已经提交GenBank,登录号为FG579859-FG580039)。经蛋白功能预测分析,获得含有TPR结构域的小的富含谷氨酰胺的蛋白、MYB类转录因子、水通道蛋白、富含脯氨酸蛋白、亲环素蛋白、ACI14蛋白、转脂蛋白等抗病相关基因,涉及到植物的信号转导,胁迫诱导,防卫反应等方面。这些EST序列为利用中国野生华东葡萄进行抗白粉病育种研究和利用提供了有价值的抗病基因片段,为丰富世界葡萄属植物抗白粉病基因提供序列数据。

英文摘要:

A cDNA library from Vitis pseudoreticulata hybrid 6-12-4 inoculated with Uncinula necator Schw. Burr was constructed by using SMARTTM cDNA Library Construction Kit. The primary library had a high titer of 2.50×10^6 pfu-mL^-1,of which 99% clones were recombinant. The amplified library had a titer of 3.0×10^9 pfu· mL^-1, of which 95% clones were recombinant. The sizer of inserted cDNAs were from 500 to 2 000 bp. A total of 300 randomly selected cDNA clones were sequenced and analyzed, of which 260 ESTs are of good quality and clustered into 183 uniseqs(These sequences had been submitted to GenBank database with accession numbers FG579859-FG580039). The deduced proteins of these ESTs include SGT1, MYB transcription factor, aquaporin, proline-rich protein, Cyclophilin, ACI14 and LTP,which were supposed to involve in the process of signal transduction, stress induction, defence reaction etc. These ESTs provided the valuable diseaseresistant gene fragments for the study and utilization of the breeding resistance to powdery mildew with Chinese wild Vitis, and enriched the disease-resistant gene data bank against powdery mildew.

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期刊信息
  • 《果树学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院郑州果树研究所
  • 主编:王志强
  • 地址:河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
  • 邮编:450009
  • 邮箱:chinagsxb@163.con
  • 电话:0371-65330928 653387308
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-9980
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1308/S
  • 邮发代号:36-93
  • 获奖情况:
  • 获河南省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18699