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皖南黑猪CETP基因单核苷酸多态检测与遗传分析
  • ISSN号:1672-352X
  • 期刊名称:安徽农业大学学报
  • 时间:2013
  • 页码:706-709
  • 分类:S828.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036, [2]安徽安泰农业集团,广德242200
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171200),科技富民强县专项行动计划,国家农业科技成果转化资金(2011GB2C300017),省级农业科技专家大院(2012)和科技部星火计划重点项目(2010GA710001)共同资助.
  • 相关项目:阈性状基因组育种值(gEBV)估计的贝叶斯方法
中文摘要:

以112头皖南黑猪为研究对象,采用PCR.SSCP方法检测胆固醇酯转运蛋白(cholesteryl ester transfer protein,CETP)基因的多态性。结果表明:(1)皖南黑猪CETP基因第1内含子795碱基处发生c—T突变(C795T);(2)在C795T突变位点中检测到CC、CT、TT3种基因型,其基因型频率分别为0.6250、0.3036和0.0714:C的基因频率为0.7768,T的基因频率为0.2232;(3)皖南黑猪CETP基因的多态信息含量(PIC)为0.2866,该位点处于中度多态;卡方检验表明,该位点的X^2值为1.7388,处于哈迪-温伯格平衡状态。

英文摘要:

One hundred and twelve pigs from Wannan Black population were used for detecting the poly- morphism of CETP gene by PCR-SSCP method. The results show as follows. (1) C〉T mutation (C795T) occurred in 795 base position of intron 1; (2) Three genotypes (CC, CT and TT) were found in C795T site, genotypic frequency of CC, CT and TT was 0.625 0, 0.303 6 and 0.071 4, respectively, gene frequency of C and T was 0.776 8 and 0.223 2, respectively; (3) The polymorphism information content (PIC) was 0.286 6 in Wannan Black popula- tion, which indicated it was moderate polymorphism. The X2 value was 1.738 8, which was in Hardy-Weinberg equilibrium in Wannan Black population (P〉0. 05).

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期刊信息
  • 《安徽农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽农业大学
  • 主编:程备久
  • 地址:合肥市长江西路130号
  • 邮编:230036
  • 邮箱:ahnydxxb@mail.hf.ah.cn
  • 电话:0551-65786465
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-352X
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1162/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 安徽省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,华东地区优秀期刊奖,全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖,安徽省优秀高校自然科学学报一等奖,全国高校优秀科技期刊一等奖,安徽省高等学校优秀学报一等奖,全国高校优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13625