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猪PLIN1基因单核苷酸多态检测与遗传分析
  • ISSN号:1672-352X
  • 期刊名称:安徽农业大学学报
  • 时间:2013.7.5
  • 页码:701-705
  • 分类:S828.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036, [2]安徽安泰农业集团,广德242200
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171200),科技富民强县专项行动计划,国家农业科技成果转化资金(2011GB2c30001÷),省级农业科技专家大院(2012)和科技部星火计划重点项目(2010GA710001)共同资助.
  • 相关项目:阈性状基因组育种值(gEBV)估计的贝叶斯方法
中文摘要:

以皖南黑猪、安庆六白猪、圩猪和霍寿黑猪共236头猪为研究对象,采用PCR-SSCP方法检测猪脂滴包被蛋白(Perilipin,PLIN1)基因的遗传多态性。结果表明,在皖南黑猪、安庆六白猪删1基因3519bp碱基处发生A〉G突变,检测到AA、AB、BB3种基因型,其中AA基因型频率在这2个群体中分别为8.97%和29.23%,AB基因型频率分别为43.59%和56.92%,BB基因型频率分别为47.44%和13.85%;皖南黑猪、安庆六白猪的多态信息含量(PIC)分别为0.3353和0.3690,在该位点均处于中度多态;卡方检验表明皖南黑猪群体和安庆六白猪群体均处于哈迪.温伯格平衡状态(P〉0.05);在圩猪、霍寿黑猪群体中PLINl基因的第2外显子没有检测到突变。PLINl基因的第3外显子在4个群体中均没有检测到突变。

英文摘要:

Two hundred and thirty-six pigs from Wannan Black pig, Anqing Liubai pig, Wei Pig and Huoshou Black pig populations were used for detecting the polymorphism of PLIN1 gene by PCR-SSCP method. The results showed that a A〉G mutation at 3 519 base position, and 3 genotypes (AA, AB and BB) were found in Wannan Black and Anqing Liubai. The genotypic frequency of AA was 8.97%, 29.23%, respectively, AB was 43.59%, 56.92%, respectively, and BB was 47.44%, 13.85%, respectively. The polymorphism information content (PIC) was 0.335 3 in Warman Black population and 0.369 0 in Anqing Liubai population, which were all in aver- age polymorphism situation. According to the Z2 test, there were in Hardy-Weinberg equilibrium in Wannan Black and Anqing Liubai population (P〉0.05), but there was no mutation in exon 2 in Wei Pig and Huoshou Black pig populations. Moreover, there was no mutation in exon 3 in these four populations.

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期刊信息
  • 《安徽农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽农业大学
  • 主编:程备久
  • 地址:合肥市长江西路130号
  • 邮编:230036
  • 邮箱:ahnydxxb@mail.hf.ah.cn
  • 电话:0551-65786465
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-352X
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1162/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 安徽省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,华东地区优秀期刊奖,全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖,安徽省优秀高校自然科学学报一等奖,全国高校优秀科技期刊一等奖,安徽省高等学校优秀学报一等奖,全国高校优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13625