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安徽地方猪TLR4基因第3外显子的SNP分析
  • ISSN号：0366-6964
  • 期刊名称：畜牧兽医学报
  • 时间：2014.11.15
  • 页码：1767-1774
  • 分类：S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构：安徽农业大学动物科技学院,安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室
  • 相关基金：国家自然科学基金项目(31171200);安徽省科技攻关重点项目(1301031032);国家农业科技成果转化资金项目(2012GB2C300207);科技富民强县专项行动计划;安徽畜禽产业共性技术研究院资助
  • 相关项目：阈性状基因组育种值(gEBV)估计的贝叶斯方法
作者： 孟云|黄龙|张晓东|殷宗俊|
关键词： 安徽地方猪, TLR4基因, 单核苷酸多态性, 群体遗传学分析
中文摘要：

本试验采用PCR-SSCP方法对皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的遗传变异进行了检测,旨在系统分析安徽地方品种猪TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据。结果检测到2个突变:G417A、C1027A,其中,G417A为非错义突变,仅在皖南黑猪、圩猪和安庆六白猪群体中检测到,且只检测到GG、GA两种基因型,在该3群体均为低度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P】0.05);C1027A为错义突变,且引起了编码氨基酸性质的改变,在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪群体中均检测到CC、CA、AA 3种基因型,在该5群体均为中度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P】0.05);χ2独立性检验结果表明,G417A、C1027A各基因型的分布在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个中外猪种间存在极显著差异(P【0.01)。结果提示,安徽地方猪TLR4基因外显子3区序列相对保守、多态含量较低,群体遗传变异程度较小;C1027A位点多态性在猪种间分布的差异是否与品种抗病性有关,值得进一步研究。

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编：文杰
  • 地址：北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编：100193
  • 邮箱：xmsyxb@263.net
  • 电话：010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号：ISSN：0366-6964
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:21857