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霍寿黑猪和长白猪TLR4基因第3外显子的SNP检测及其遗传差异分析
  • ISSN号:1672-352X
  • 期刊名称:安徽农业大学学报
  • 时间:2014.8
  • 页码:808-812
  • 分类:S813.3[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室, 安徽安泰农业集团, 安徽农业大学动物科技学院,安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036, [2]安徽安泰农业集团,广德242200
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171200); 安徽省科技攻关重点项目(1301031032); 国家农业科技成果转化资金项目(2012GB2C300207); 科技富民强县专项行动计划; 安徽畜禽产业共性技术研究院共同资助
  • 相关项目:阈性状基因组育种值(gEBV)估计的贝叶斯方法
中文摘要:

为了对安徽地方猪霍寿黑猪和引进猪种长白猪TLR4基因进行多态性分析,采用PCR-SSCP结合PCR产物双向测序的方法研究了86头霍寿黑猪及44头长白猪2个群体共130个样本TLR4基因外显子3部分片段的单核苷核多态性,并对检测到的突变位点进行群体遗传学分析。结果检测到1个突变C1027A,C1027A突变为错义突变。群体遗传学分析表明,该多态位点基因型的分布在霍寿黑猪和长白猪2个中外猪种间存在极显著差异(P〈0.01)。C1027A位点多态性在地方猪品种和引进品种间的差异,是否与品种抗病性有关,值得进一步研究。

英文摘要:

Single nucleotide polymorphisms of TLR4 exon 3 in 86 Huoshou black and 44 landrance pigs (atotal of 130 individuals in two populations) were detected using PCR-SSCP and bi-directional DNA sequencing.The detected SNPs were further analyzed using population genetics for their genetic variations. One SNP site(C1027A) was detected to be a no-synonymous SNP site. The result showed that the distribution of theC1027A-polymorphic genotype was significantly different (P〈0.01) at the 1027 locus between Landrace and Hu-oshou black pigs. Such differences at the 1027 locus between local and introduced pigs might correlate with resis-tance of certain diseases.

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期刊信息
  • 《安徽农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽农业大学
  • 主编:程备久
  • 地址:合肥市长江西路130号
  • 邮编:230036
  • 邮箱:ahnydxxb@mail.hf.ah.cn
  • 电话:0551-65786465
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-352X
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1162/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 安徽省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,华东地区优秀期刊奖,全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖,安徽省优秀高校自然科学学报一等奖,全国高校优秀科技期刊一等奖,安徽省高等学校优秀学报一等奖,全国高校优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13625