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3个安徽地方猪品种TAP1基因编码区遗传多态性分析
  • ISSN号:1672-352X
  • 期刊名称:安徽农业大学学报
  • 时间:2014.8
  • 页码:813-817
  • 分类:S813.3[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036, [2]安徽安泰农业集团,广德242200
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171200); 安徽省科技攻关重点项目(1301031032); 国家农业科技成果转化资金项目(2012GB2C300207); 科技富民强县专项行动计划; 安徽畜禽产业共性技术研究院项目共同资助
  • 相关项目:阈性状基因组育种值(gEBV)估计的贝叶斯方法
中文摘要:

以3个安徽地方猪品种皖南黑猪、圩猪和霍寿黑猪共324头猪为研究对象,采用PCR-SSCP方法检测猪TAP1基因编码区的遗传多态性。结果表明,在皖南黑猪、圩猪和霍寿黑猪TAP1基因的第10外显子41 bp碱基处发生G〉A突变,检测到AA、GA、GG 3种基因型,其中AA基因型频率在这3个群体中分别为59.53%、41.27%和54.91%,为优势基因型;皖南黑猪、圩猪和霍寿黑猪的多态信息含量(PIC)分别为0.2991、0.3611和0.3242,在该位点均处于中度多态。卡方检验表明,皖南黑猪、圩猪和霍寿黑猪群体均处于哈迪-温伯格平衡状态(P〉0.05)。

英文摘要:

A total of 324 pigs from Wannan black pig, Wei pig, and Huoshou black pig populations were usedto detect polymorphisms of the TAP1 gene coding sequence using PCR-SSCP method. Results showed that a G 〉A mutation occurred at 41-base-position in exon 10, resulted in three genotypes (AA, GA and GG) in the three pigpopulations. The genotypic frequencies of AA in Wannan black pig, Wei pig, and Huoshou black pig populationwas 59.53%, 41.27%, and 54.91%, respectively. Genotype AA is a dominant genotype. The polymorphism infor-mation content (PIC) was 0.2991 in Wannan black, 0.3611 in Wei pig, and 0.3242 in Huoshou black pig popula-tion, which was ranged at the medium level of polymorphism. The Z2 test indicated the Hardy-Weinberg equilib-rium in the three pig populations (P〉0.05).

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期刊信息
  • 《安徽农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽农业大学
  • 主编:程备久
  • 地址:合肥市长江西路130号
  • 邮编:230036
  • 邮箱:ahnydxxb@mail.hf.ah.cn
  • 电话:0551-65786465
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-352X
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1162/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 安徽省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,华东地区优秀期刊奖,全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖,安徽省优秀高校自然科学学报一等奖,全国高校优秀科技期刊一等奖,安徽省高等学校优秀学报一等奖,全国高校优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13625