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绵羊肺炎支原体贵州株P113基因的克隆与生物信息学分析
  • ISSN号:1004-1389
  • 期刊名称:《西北农业学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.62[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]贵州大学动物科学学院,贵阳550025, [2]贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵阳550025, [3]贵州省动物疫病预防控制中心,贵阳550008
  • 相关基金:黔西南州种草养羊产业发展省州科技合作专项(黔西南科合[2012]5号); 贵州省自然科学技术基金(黔科合J字[2015]2082号); 贵州省农业攻关(黔科合NY[2014]3042); 贵州省科技创新人才团队项目(黔科合人才团队[2015]4016号); 贵州大学研究生创新基金(校基金研农2015029号)
中文摘要:

为获得绵羊肺炎支原体贵州株P113基因生物信息学特征,应用DNAStar、Mega 5.0、Protparam、Protscale、IEBD等工具对其(GZ-QX1株)P113蛋白特性、结构和功能进行预测分析。结果显示,绵羊肺炎支原体GZ-QX1株P113基因序列大小为3 240bp,编码1 079个氨基酸,与绵羊肺炎支原体Y98标准株、四川SC01株、猪肺炎支原体P97、丝状支原体山羊亚种、山羊支原体山羊亚种的核苷酸序列同源性分别为99.9%、81.9%、60.4%、3.9%和5.2%。P113蛋白是分子质量约119ku的碱性蛋白,具有较多优势抗原表位;蛋白结构分析显示,P113蛋白无跨膜结构,有9个N糖基化位点,59个丝氨酸、16个苏氨酸的磷酸化位点,14种保守的特异性蛋白质激酶的结合位点;蛋白功能分析认为,P113可能是某信号传导通路的信号分子,也是一种具有良好抗原性的结构蛋白。

英文摘要:

The assay was aimed to access the biological characteristics of P113 protein in Mycoplasma ovipneumoniae(Mo)Guizhou strain(GZ-QX1).The protein structure,characteristics and function of GZ-QX P113 protein were predicted and analyzed by DNASTAR,MEGA 5.0softwares,Protparam,Protscale and IEBD online tools in this study.The results showed that Mo GZ-QX1 P113 gene predicted is 3 240 bp,encoding 1 079 amino acid(AA),and sharing nucleotides sequence identity 99.9% with Mo Y98 standard strains 81.9% with SC01 Sichuan strain,60.4% with Mycoplasma hyopneumoniae P97,3.9% with Mycoplasma mycoides and 5.2% with Mycoplasmacapripneumoniae.The molecular weight of P113 protein is 119 ku,with more advantages antigen epitope protein structure.Protein structure analysis showed that the protein had no transmembrane domain.There were 9N-glycosylation sites,59 serine,16threonine may be phosphorylated predicted and 14 conserved and specific phosphkinase binding sites.Protein functional analysis showed that P113 may function as a mediator in signaling pathway,but also a kind of good antigenic structure of proteins.

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期刊信息
  • 《西北农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 甘肃、宁夏、青海、新疆农(林)业科学院 青海、新疆畜牧(兽医)科学院及新疆农垦科学院
  • 主编:廖允成
  • 地址:陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学西林校区大铁10号信箱
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbnx@chinajournal.net.cn
  • 电话:029-87082760 87082010
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-1389
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1220/S
  • 邮发代号:52-111
  • 获奖情况:
  • 教育部科技司颁发的"优秀科技期刊二等奖"等
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:27312