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生物信息网格工作流中的多流水服务调度与多粒度副本创建
  • ISSN号:1000-1220
  • 期刊名称:小型微型计算机系统
  • 时间:0
  • 页码:594-600
  • 语言:中文
  • 分类:TP331[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]华中科技大学计算机科学与技术学院,湖北武汉430074, [2]生物信息学与分子成像湖北省重点实验室,湖北武汉430074
  • 相关基金:国家大平台项目(2005DKA64001)资助;国家自然科学基金项目(90608020)资助.
  • 相关项目:人类遗传疾病相关基因的生物信息学分析与预测
中文摘要:

针对生物信息学应用中不同实例之间数据不相关、实例各片段间数据部分依赖的特点,将流水线原理融合到工作流中,同一流程的不同实例分级并行执行,流程间实例或片段流水执行,实现了多级流水线效果,进而在实例或片段执行过程中根据资源空闲程度与任务执行状态实施动态多粒度副本创建机制,均衡系统负载,提高资源利用率,有效降低了整个应用流程的执行时间.

英文摘要:

To improve the service scheduling performance in heterogeneous bioinformatics grid platform, a new strategy which integrates multi-pipelining and dynamic multi-granularity replica with grid workflow is proposed. Two scheduling algorithms, i.e. MP-gridWF and MP&MR-gridWF, are discussed respectively. The experiment results indicate that significant improvements are achieved in multifarious scenarios and optimal makespan can be gained.

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期刊信息
  • 《小型微型计算机系统》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院沈阳计算技术研究所
  • 主编:林浒
  • 地址:沈阳市浑南新区南屏东路16号
  • 邮编:110168
  • 邮箱:xwjxt@sict.ac.cn
  • 电话:024-24696120 024-24696190-8870
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1220
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1106/TP
  • 邮发代号:8-108
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23212