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A型禽流感病毒的分子模式

ISSN号：0023-074X
期刊名称：科学通报
时间：0
页码：927-933
语言：中文
分类：S855.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医] TP311.13[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
作者机构：[1]华中科技大学系统生物学系,湖北省生物信息与分子成像重点实验室,武汉430074, [2]中国科学院武汉病毒研究所,病毒学国家重点实验室,武汉430071, [3]中国科学院动物研究所,北京100080, [4]中国科学院国家人类基因组研究中心,上海201203
相关基金：国家科技基础性工作专项（批准号：2007FY210700）、国家自然科学基金重大研究计划（批准号：90608020）、国家重点基础研究发展计划（批准号：2005CB523007,2005CB523004）、高等学校博士点专项科研基金（批准号：20050487037）、中国科学院知识创新工程重要方向性项目（批准号：KSCX2-YW-N-065）及欧盟第六框架项目（批准号：SP5B-CT-2006-044161,SP5B-CT-2006-044405）资助致谢感谢胡志红研究员和SimonRayner博士的帮助和讨论.
相关项目：人类遗传疾病相关基因的生物信息学分析与预测

中文摘要：

A型禽流感病毒能跨越宿主屏障,引起人死亡.高致病性禽流感H5N1亚型病毒就是一个特例.跨宿主传播的分子机理目前仍不清楚.将不同亚型的237株流感病毒的内部蛋白序列转化为伪信号,采用小波包分解的方法提取能量特征.依据每株病毒的能量特征值,进行层次聚类.聚类结果显示,5种分子模式存在A型禽流感病毒中,并与跨宿主传播的表型相关联.分析结果同时显示,模式为C和E的病毒可以跨越宿主屏障,而模式为A,B和D的病毒缺乏此种能力.结果表明,可以用来构建一个早期预警系统,用来预测A型禽流感跨越宿主传播的可能性.

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