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Sequence Similarity Analysis of Non-Self CTL Epitopes and Mouse Proteins Using Sequence Alignment
  • ISSN号:1000-1190
  • 期刊名称:《华中师范大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q811.4[生物学—生物工程] Q939.91[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory,Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074,Hubei, China
  • 相关基金:Supported by the National Natural Science Foundation of China (90608020, 30971642);; the Program for New Century Excellent Talents in University (NCET-060651);; the National Platform Project of China (2005DKA64001);; Ministry of Education of China (20050487037);; the Natural Science Foundation of Hubei Province (2009CDA161)
中文摘要:

这研究分析了老鼠抗体和老鼠蛋白质认出的非自我 T 房间 epitopes 的氨基酸顺序类似。用顺序排列,我们仅仅发现了那 1 108 epitopes 中的 8 个高度类似于老鼠蛋白质序列。结果证明非自我 T 房间 epitopes 不是类似的或有小类似到老鼠蛋白质序列。而且,考察相关文学,我们也发现八 epitopes 将在一些特别环境触发有免疫力的回答,它被 T 房间处于正常状况忽略。结果不建议那或低类似的肽疫苗能减少跨反应的担保的机会并且提高抗原特定的有免疫力的反应到疫苗。

英文摘要:

This research analyzed amino acid sequence similarity between non-self T cell epitopes recognized by mouse antibodies and mouse proteins. Using sequence alignment,we found that only 8 of 1 108 epitopes are highly similar to mouse protein sequences. The result shows that non-self T cell epitopes are not similar or have little similarity to mouse protein sequences. Furthermore,reviewing the related literature,we also found that the eight epitopes would trigger immune responses in some particular environment,which are ignored by T cells in normal condition. The result suggests that no or low-similarity peptide vaccines can reduce the chance of collateral cross-reactions and enhance the antigen-specific immune response to vaccine.

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期刊信息
  • 《华中师范大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:华中师范大学
  • 主编:范军
  • 地址:武昌桂子山
  • 邮编:430079
  • 邮箱:inbox@mail.ccnu.edu.cn
  • 电话:027-67868127
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1190
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1178/N
  • 邮发代号:38-39
  • 获奖情况:
  • 全国综合性科学技术核心期刊,中国科学引文数据库来源期刊,中国科技论文统计源期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:8526