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采用SELDI蛋白质芯片技术研究氧化亚铁硫杆菌对磷酸盐缺失的反应(英文)
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.97[生物学—微生物学] Q946.1[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]中南大学资源加工与生物工程学院,长沙410083, [2]中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,长沙410078
  • 相关基金:国家自然科学基金创新研究群体基金资助项目(50621063),国家自然科学基金(30400010,30570047)和国家重点基础研究发展规划(2004CB619204)资助项目.
中文摘要:

氧化亚铁硫杆菌(At.f)是能够利用Fe^2+和硫化矿来获取能量的一种化能自养菌.这种细菌在金属硫化矿的生物浸出中起着重要的作用.在硫化矿的生物浸出过程中,浸矿细菌通常会遇到多种胁迫条件,如温度的变化、营养成分的缺失和pH值的变化等,这些因素会影响到细菌的活性.因此对在胁迫条件下这类细菌的应急反应生理机制的研究具有重要的意义.SELDI蛋白质芯片技术是近年一种高通量的蛋白质组学研究技术.测定了以Fe^2+为能源正常条件培养的At.f和磷酸盐缺失培养At.f的生长情况,绘制了相应的生长曲线;采用NP20蛋白质芯片,对At.f总蛋白的蛋白质芯片上样量进行了优化.在此基础上,采用IMAC-Cu、SAX2、WCX2三种特异性SELDI蛋白质芯片技术,获取了磷酸盐缺失培养At.f与正常条件培养的At.f的比较蛋白质图谱,采用软件对比较蛋白质图谱进行分析,发现了磷酸盐缺失培养At.f的13个明显差异表达的蛋白质分子,为进一步分离鉴定这些差异表达蛋白质奠定了基础.

英文摘要:

A cidithiobacillus ferrooxidans is a chemolithotrophic microorganism capable of using ferrous ions and sulphides as energy sources. This microorganism has an important role in the bioleaching of minerals. During this process, the bacteria arc normally subjected to several stressing conditions, such as temperature changes, lack of nutrients or pH changes, which may affect the efficiency of the bacterial action. SELDI is a recent technology that allows for high-throughput proteomics studies. The Protein Chip SELDI technology was used to generate comparative protein profiles of A cidithiobacillus ferrooxidans grown under phosphate starvation or normal condition additionally adding Fe^2+ as energy resource. There were 13 significantly differential expressed protein's peaks found by using SELDI Protein Chip technologies, which made a solid foundation for further isolation these low molecular proteins by adopting technologies such as HPLC etc.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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