跨学科研究项目是实施博士生跨学科教育的重要载体。伴随着跨学科项目的起始、发展和结束,博士生在这三个阶段相应地也会体验到学科认同危机与学科之间的理解和沟通压力,平衡来自学科和跨学科项目双重期望的压力,整合研究成果与寻求职业发展的困境等阶段性挑战和困惑,并且,这种挑战在整个跨学科项目中既是线性出现的也是不断反复的。要有效促进博士生的跨学科学习与研究,需要培养学生的团队归属感,在团队成员之间建立起研究共识和有效的沟通机制,对跨学科项目提供必要的财政和制度支持,博士生要自我规划和管理学业进展并对其他学科进行欣赏式探寻等。