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基于LTR-FINDER分析葡萄基因组中LTR反转录转座子
  • ISSN号：0439-8114
  • 期刊名称：《湖北农业科学》
  • 时间：0
  • 分类：Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构：[1]郑州大学河南省离子束生物工程重点实验室,郑州450052, [2]洛阳农林科学院,河南洛阳471022, [3]洛阳师范学院生命科学系,河南洛阳471022
  • 相关基金：国家自然科学基金项目（30800204）
作者： 李卫涛[1], 张焕丽, 押辉远[3]
关键词： 葡萄(Vitis, vinifera), LTR反转录转座子, 基因组, grape（Vitis vinifera）, LTR retrotransposons, genome
中文摘要：

运用LTR-FINDER对葡萄（Vitis vinifera）基因组中的19条染色体LTR反转录转座子进行分析。结果表明,葡萄基因组中19条染色体上共检索到5 470个LTR反转录转座子,约占葡萄基因组10.7%。LTR反转录转座子分析为进一步开展葡萄品种鉴定和遗传多样性分析奠定了基础。

英文摘要：

The compositions of LTR retrotransposon of 19 chromosomes in the grape genome were analyzed based on the LTR-FINDER.The results showed that 5 470 LTR retrotransposons were detected,occupying about 10.7% of grape genome.The analysis of LTR retrotransposons laid the foundation for further development of the grape variety’s identification and genetic diversity analysis.

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期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编：焦春海
  • 地址：武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编：430064
  • 邮箱：hbnykxxzz@126.com
  • 电话：027-87389334
  • 国际标准刊号：ISSN：0439-8114
  • 国内统一刊号：ISSN：42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:30537