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肠道病毒71型基因组中小干扰RNA的靶位点预测
  • ISSN号:1000-1638
  • 期刊名称:《内蒙古大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q61[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特010021
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(90403010).
中文摘要:

肠道病毒71型(EV71)已经在世界范围内有过十多次大的爆发与流行,近年来EV71病毒的流行在亚洲逐渐呈上升的趋势,但是目前尚无有效的治疗措施,因此迫切需要一种治疗EV71的有效药物。本文采用生物信息学的方法,对人类EV71病毒三个不同株型(SHZH03,SHZH98和MS)RNA序列的局域二级结构进行了预测,并从这些病毒株的基因组中分别得到了长度在21~25nt的小干扰RNA靶序列碱基片段。这一结果将有助于治疗EV71药物的开发研究,对预防和控制EV71的爆发和流行也会有重要意义。

英文摘要:

With the epidemic of the human enterovirus 71 ( EV71 ) worldwide and in the absence of any effective anti - enteroviral therapy, there is clearly a need to find a specific anti- EV71 agent. In this study, following bioinformatic method, we analyzed the local secondary structures of the RNA genome from three EV71 strains, namely, SHZH03, SHZH98 and MS. Several 21 ~ 25 base- long sequence segments in these genomes are predicted as the optimal target sites of small interfering RNA duplexes, respectively. The results will contribute to the pharmaceutical research and therapy of the epidemic intestinal virus EV71.

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期刊信息
  • 《内蒙古大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:内蒙古自治区教育厅
  • 主办单位:内蒙古大学
  • 主编:李光鹏
  • 地址:呼和浩特市赛罕区大学西路235号
  • 邮编:010021
  • 邮箱:
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1638
  • 国内统一刊号:ISSN:15-1052/N
  • 邮发代号:16-67
  • 获奖情况:
  • 综合性科技类核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:6683