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Alu中剪接位点的研究
  • 期刊名称:生物信息学 2007
  • 时间:0
  • 分类:Q61[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]内蒙古大学理工学院,呼和浩特010021
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(90403010,10447003)
  • 相关项目:保守非基因序列(CNGs),非编码RNA序列(Non-cod
中文摘要:

对Alu剪接位点双碱基的类型、分布进行了分析,发现非标准剪接(不满足GT-AG规则)占很大优势。而且非标准剪接的分布频率会随不同的染色体而变化,在Alu剪接较多的11、12、17号染色体上分布最多。通过对Alu及其剪接住点碱基关联的计算分析,说明在Alu中剪接位点双碱基的这种异常使用主要是由Alu中二联体的关联压力造成的,从而表明这种重复序列对生命活动的多样化起着重要作用。

英文摘要:

analysis on the types and distribution of splice sites in Alus indicates that non- standard sites are abundant as a departure from the GT- AG rule. The frequencies of non - standard splice sites vary with chromosomes, such as more residing on chr. 11, 12, 17. By a statistical approach, we found that the splice sites are subject to dinucleotide appearances in Aius, and thereby such repetitive elements have increased the versatility of the genome.

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