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乳酸菌中移动基因元件的预测与分析
  • ISSN号:1001-2230
  • 期刊名称:《中国乳品工业》
  • 时间:0
  • 分类:Q933[生物学—微生物学]
  • 作者机构:东北农业大学,乳品科学教育部重点实验室,哈尔滨150030
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171717);国家“863计划”(2012AA022108).
中文摘要:

CRISPR—Cas系统作为获得性免疫系统能够保护乳酸菌免受噬菌体等外源基因元件的入侵,旨在对乳酸菌中CRISPR—Cas系统的活性与近期发生水平基因转移的程度是否呈负相关进行检验。预测了乳酸菌中的CRISPR—Cas系统、前噬菌体及基因岛,并分别分析乳酸菌中CRISPR与前噬菌体及与基因岛在数量上的相关性。研究发现CRISPR序列的长度(能反映该免疫系统的活性)与预测的近期发生的水平基因转移事件的数目之间没有明显的相关性。结果表明乳酸菌中的CRISPR—Cas系统并不抑制水平基因转移事件的发生。

英文摘要:

We aimed to test that whether the activity of CRISPR - Cas in microbes is negatively correlated with the extent of recent HGT or not. We predict the CRISPR - Cas systems, prophages and genomic islands to analysis the correlations between CRISPR spacer count and HGT measures. We found no significant dependence between the length of CRISPR arrays, which reflects the activity of the immune system, and the estimated number of recent HGT events. No evidence of inhibition of horizontal gene transfer by CRISPR - Cas on evolu- tionary timescales.

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期刊信息
  • 《中国乳品工业》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国轻工业联合会
  • 主办单位:黑龙江省乳品工业技术开发中心 中国乳制品工业协会
  • 主编:刘鹏
  • 地址:哈尔滨市松北区科技创新城创新1路2727号
  • 邮编:150028
  • 邮箱:zgrpgy@163.com
  • 电话:0451-86662740
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-2230
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1177/TS
  • 邮发代号:14-136
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,全国优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11583