政府研发资助是引导和调控企业技术创新的重要手段。本文运用系统广义矩估计和门槛回归方法,采用2001~2008年中国37个行业的面板数据对政府研发资助政策的有效性及行业差异进行了实证分析。结果表明我国政府研发资助有效激励了企业研发动机的提高,对企业研发投入并不存在挤出效应;政府研发资助的行业差异较为显著:技术密集型行业的政府资助激励效应最强,资本密集型和资源密集型行业次之,对劳动密集型行业的激励效果不显著,最优的研发资助水平也存在显著的行业差异;此外,在不同的技术外溢强度下,政府研发资助对企业研发的激励作用呈现显著的区间效应,外溢性越大,激励作用越强越有效。