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猪腺病毒3型SYBR GreenⅡ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
  • ISSN号:1673-4696
  • 期刊名称:《中国兽医科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]四川农业大学动物生物技术中心,四川成都611130, [2]四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川成都611130
  • 相关基金:四川省科技支撑计划项目(2014NZ0043); 科技部国际科技合作项目(2014DFA31260); 教育部“长江学者与创新团队发展计划”项目(IRT13083)
中文摘要:

为建立一种针对猪腺病毒3型(PADV3)的检测方法,根据PADV3E1B基因保守序列设计1对引物,建立了检测PADV3的SYBR GreenⅡ实时荧光定量PCR。结果显示,该方法不能对猪瘟病毒、猪流行性腹泻病毒、猪博卡病毒、猪传染性胃肠炎、伪狂犬病病毒、猪圆环病毒2型、大肠杆菌、猪链球菌2型检测到荧光信号,特异性好;检测PADV3时在3.7×10^2-3.7×10^9 copies/μL范围内具有良好的线性关系,其扩增相关系数为0.999,扩增产物的熔解曲线仅出现单一特异峰,无引物二聚体,熔解温度为90.5℃;该方法组内变异系数为0.17%-1.23%,组间变异系数为0.73%-2.23%,重复性较好。应用该方法对临床56份腹泻粪便检测,检出11份阳性,且与常规PCR检测方法的阳性符合率为100%。上述结果表明,建立的实时荧光定量PCR为PADV3感染的早期诊断、流行病学调查奠定了技术基础。

英文摘要:

In order to establish a real-time PCR based on SYBR GreenⅡfor detection of porcine adenovirus type 3(PADV3),apair of special primers was designed according to the conserved sequences of E1 Bgene in GenBank.In result,the standard curve of established SYBR GreenⅡreal-time PCR had a wide dynamic range from 3.7×10^2 to 3.7×10^9 copies/μL with a linear correlation(r2)of 0.999.The melting curve analysis using SYBR GreenⅡdye showed one specific peak with a melting temperature(Tm)of 90.5℃.No amplification was detected from the DNA samples of classical swine fever virus,porcine epidemic diarrhea virus,porcine bocavirus,transmissible gastroenteritis virus of swine,pseudorabies virus,porcine circovirus type 2,Escherichia coli and Streptococcus suis type 2by this PCR,respectively.Excellent reproducibility was obtained for detecting constructed positive plasmid DNA with intra-assay of 0.17% to1.23% and inter-assay of 0.73% to 2.23%.Further detection of 56 specimens showed that 11 of them were PADV3 positive by this method,and the results of the quantitative PCR were the same as that of the conventional PCR.In conclusion,the real-time PCR established in this study will be useful for earlier rapid laboratory diagnosis and epidemiological investigation of the infection of PADV3.

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期刊信息
  • 《中国兽医科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院兰州兽医研究所
  • 主编:殷宏
  • 地址:兰州市盐场堡徐家坪1号
  • 邮编:730046
  • 邮箱:zgsykx@zgsykx.com
  • 电话:0931-8310086 8342195
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-4696
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1192/S
  • 邮发代号:54-33
  • 获奖情况:
  • 2003年获第二届国家期刊奖百种重点期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6141