在股权分置改革的背景下,文章用12个变量通过主成分分析法得出企业的综合治理指标,为减少内生性影响,运用两阶段最小二乘法模型,实证检验了中国证券市场中机构投资者在不同产权性质下的治理作用,以及具有公有产权的社保基金和私有产权的证券投资基金在上市公司中的不同治理作用。从2006—2014年分年度的回归结果显示,随着二元股权结构改革的推进,机构投资者越来越积极地在公司经营管理活动中发挥作用,九年的混合面板数据结果显示,各类机构投资者整体持股比例与公司治理水平正相关,并且在非国有企业中治理作用发挥效果更好。同时,独立的证券基金发挥了显著的治理作用,而具有公共产权性质的社保基金,其持股比例与公司治理水平之间却没有显著的正向关系。