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microRNA靶基因预测算法研究概况及发展趋势
  • ISSN号:1004-0374
  • 期刊名称:《生命科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q522[生物学—生物化学] Q811.4[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]江苏大学医学技术学院,镇江212013, [2]中国科学院计算技术研究所,北京100080
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30671984;30471627;30300169); 江苏省自然科学基金资助项目(Bk2004405)
中文摘要:

microRNA(miRNA)是一类约22个核苷酸(nt)长的非编码小分子RNA,广泛存在于动植物细胞中,通过和靶基因的不精确互补配对而裂解mRNA或抑制翻译的起始。准确地预测miRNA靶基因和正确地认识miRNA及其靶基因的作用机理已成为当前研究的热点。作者试图对目前常用的10余个高等生物miRNA靶基因预测软件的实现原理、适用对象及各算法的创新之处等加以综述,以便为进行靶基因预测算法设计人员提供参考,对生物学实验验证提供更好的理论指导。

英文摘要:

 MicroRNAs(miRNAs) are a new class of 22nt long small noncoding RNA species in plants and animals, which cleavage the mRNA or repress the initiation of the mRNA translation by partially base pairing with the targets in animals. Predicting the targets of miRNAs and investigating the interaction between miRNAs and the corresponding targets are becoming the study focus. Here, we reviewed the principles, creativities and application ranges of the 10 leading miRNA target prediction algorithms including miRanda, PicTar and so on, in order to assist the biologist and other miRNA researchers.

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期刊信息
  • 《生命科学》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:国家自然科学基金委员会生命科学部 中国科学院生命科学与生物技术局 中国科学院生命科学和医学学部 中国科学院上海生命科学研究院
  • 主编:王恩多
  • 地址:上海岳阳路319号31号楼B座403中国科学院上海文献情报中心
  • 邮编:200031
  • 邮箱:CBLS@SIBS.AC.CN
  • 电话:021-54922830
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-0374
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1600/Q
  • 邮发代号:4-628
  • 获奖情况:
  • 1996年获上海市优秀科技期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:9112