东篱科研大数据发现系统（DRDS）

位置：成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页

DHRS4L2非编码RNA调控CPNE6基因表达

期刊名称：Chin J Biochem Mol Biol
时间：2014.11.7
页码：1098-1105
分类：R394.3[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学] R730.264[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
作者机构：[1]广东医学院附属深圳南山医院中.实验室和深圳内源性感染重点实验室,广东深圳518052, [2]汕头大学医学院细胞生物学教研室,广东汕头515041, [3]广东医学院附属深圳南山医院胃肠外科,广东深圳518052
相关基金：国家自然科学基金（No.31100943）,深圳市南山区科技研发资金（No.2010012）,深圳市科技计划项目（医疗卫生类）（No.201102136）
相关项目：维甲酸合成酶和代谢酶介导WT1调控维甲酸信号通路参与肾脏发育的研究

关键词： DHRS4L2, CPNE6, 选择性剪接, 转录调控, 人神经母细胞瘤, DHRS4L2, CPNE6, alternative splicing, transcription regulation, human neuroblastoma

中文摘要：

DHRS4／NRDR基因编码一种属于SDR家族的酶，在维甲酸合成、类固醇代谢和苯甲基代谢中发挥生物合成催化作用．DHRS4基因定位于14q11．2，有两个相似的拷贝基因，分别为DHRS4L2和DHRS4LI．我们前期发现了DHRS4L2基因一个上游转录起始位点，命名为DHRS4L2-Ea．在本研究中，我们用RT-PCR和双脱氧测序法发现一个新的从DHRS4L2-Ea转录的选择性剪接亚型DHRs4L2-900a（KC237374）．同时RT-PCR结果显示在sK-N．SH细胞DHRs4L2-Ea选择性剪接亚型中DHR$4L2-iso（AY616183）表达最多，为主要亚型．在SK-N-sH细胞过表达DHRS4L2-800a（AY920361）使DHRS4L2-Ea基因下游CPNE6mRNA表达下调．在HeLa细胞过表达DHRS4L2．800a（AY920361）或DHRS4L2-900a（KC237374）进一步表明DHRs4L2-Ea抑制CPNE6表达的作用．定量PCR结果显示si-RNA抑制DHRS4L2-Ea表达使CPNE6mRNA表达上调．亚硫酸盐测序结果显示在SK-N-SH转染DHRS4L2-800a（AY920361）的样本中CPNE6基因DNACpG甲基化增加．综上所述，本研究揭示DHRS4L2表达的非编码RNA抑制其下游基因CPNE6的表达．

英文摘要：

The DHRS4/NRDR gene encodes an enzyme of the SDR family for retinoic acid biosynthesis, steroids metabolism and benzyl metabolism. In humans, DHRS4 maps to 14qll. 2, together with other two tandem repeated genes, DHRS4L2 and DHRS4L1. The transcription start site of the DHRS4L2 gene was previously identified as DHRS4L2-Ea. Here we discovered an alternatively spliced form, DHRS4L2- 900a （KC237374） , by RT-PCR and Sanger sequencing. We found another spliced form, DHRS4L2-iso （AY616183）, was most abundant in SK-N-SH cells. The overexpression of DHRS4L2-800a （AY920361） in SK-N-SH inhibited the mRNA expression of CPNE6, a gene adjacently downstream of DHRS4L2. Overexpression of DHRS4L2-800a and DHRS4L2-900a also repressed CPNE6 expression in HeLa ceils. Knockdown of DHRS4L2-Ea by si-RNA increased CPNE6 expression. Transfection of DHRS4L2-800a mildly increased the methylation of CPNE6 promoter DNA in SK-N-SH cells as shown by bisulfite sequencing. We concluded that spliced DHRS4L2 transcripts inhibited the expression CPNE6.

同期刊论文项目