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IkB激酶β和DNA聚合酶β易感基因位点与中国汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究
  • ISSN号:1007-7480
  • 期刊名称:《中华风湿病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R735.1[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]青岛大学附属医院风湿科,266003, [2] 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院风湿免疫科风湿免疫病学教育部重点实验室
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划(863计划)(2011AA02A113);国家自然科学基金(81373188;81241094);卫生公益性行业科研专项(201202004);山东省科技发展计划(2011YD18030);青岛市科技计划(13-4.138-jch)
中文摘要:

目的 分析IkB激酶β(IKBKB)rs12676482,rs2272733和DNA聚合酶β(POLB)rs3136717,rs3136744基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族人群SLE遗传易感性的关系,探讨这些位点与SLE的相关性.方法 采用PCR-连接酶检测反应(LDR)技术对908例SLE患者和961名健康对照进行基因分型,结合SLE实验室及临床表现,分析该位点与疾病及临床表型的相关性.分型结果用PLINK1.07软件进行统计分析,所选SNP位点等位基因频率和基因型频率进行x2检验,3种遗传模型(加性模型、显性模型和隐性模型)基因型频率应用Logistic回归进行分析.结果 rs12676482在对照组中AA、AG、GG基因型频率和A、G等位基因频率分别为0.9%(8/938)、15.7%(147/938)、83.4% (783/938)、8.7%(163/1 876)、91.3%(1 713/1 876),SLE组中为1.4%(12/888)、15.6%(139/888)、83.0% (737/888)、9.2%(163/1 776)、90.2%(1613/1 776),2组基因型频率和等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);rs2272733在对照组中TT、TC、CC基因型频率和T、C等位基因频率分别为1.1%(10/938)、16.7%(157/938)、82.2%(771/938)、9.4%(177/1 876)、90.6%(1 699/1 876),SLE组中为1.4%(12/888)、16.3%(145/888)、82.3%(731/888)、9.5%(169/1 776)、90.5%(1 607/1 776),2组基因型频率和等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);rs3136717在对照组中CC、CT、TT基因型频率和C、T等位基因频率分别为1.1%(10/938)、16.7%(157/938)、82.2%(771/938)、9.4%(177/1 876)、90.6%(1 699/1 876),SLE组中为1.4%(12/888)、16.7%(148/888)、82.0%(728/888)、9.7%(172/1 776)、90.3%(1 604/1 776),2组基因型频率和等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);rs3136744在对照组中CC、CA、AA基因型频率和C、A等位基因频率分别为0.6%(6/938)、13.6%(128/938)、85.7%(804/938)、7.4?

英文摘要:

Objective To investigate the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of IKBKB (rs 12676482,rs2272733) and POLB (rs3136717,rs3136744)with systemic lupus erythematosus (SLE)in Chinese Han population.Methods SNPs from a cohort of 908 SLE patients and 961 healthy controls were genotyped using polymerase chain reaction-ligase detection reaction (PCR-LDR).The associations of the SNPs with the clinical manifestations and various serological markers of SLE were analyzed.x2-test was applied to compare allele and genotype frequencies between cases and controls using the PLINK 1.07 software.Three Logistic regression models (additive,dominant,and recessive) were used to analyze the SNPs.Results In the healthy control group,rs12676482 AA,AG,GG genotype frequency and A,G allele frequencies were as follows:0.9% (8/938),15.7% (147/938),83.4% (783/938),8.7% (163/1 876),91.3% (1 713/1 876),those of the corresponding case group were as follows:1.4%(12/888),15.6%(139/888),83.0%(737/888),9.2%(163/1 776),90.2%(1 613/1 776),genotype and allele frequencies were not statistical significantly different between SLE patients and healthy controls (P〉0.05).In healthy control group,rs2272733 TT,TC,CC genotype frequency and T,C allele frequencies were as follows:1.1%(10/938),16.7%(157/938),82.2%(771/938),9.4%(177/1 876),90.6%(1 699/1 876),those of the SLE patients group was as follows:1.4%(12/888),16.3%(145/888),82.3%(731/888),9.5%(169/1 776),90.5%(1 607/1 776),genotype and allele frequencies were not statistical significantly different between SLE patients and healthy controls (P 〉0.05).In the healthy control group,rs3136717 CC,CT,TT genotype frequency and C,T allele frequencies were as follows:1.1%(10/938),16.7%(157/938),82.2%(771/938),9.4%(177/1 876),90.6%(1 699/1 876),those of the patient group were as follows:1.4% (12/888),16.7% (148/888),82.0% (728/888),9.7% (172/1

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期刊信息
  • 《中华风湿病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
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  • 邮编:030013
  • 邮箱:cmafsb@163.com
  • 电话:0351-7553295 7553182
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7480
  • 国内统一刊号:ISSN:14-1217/R
  • 邮发代号:22-153
  • 获奖情况:
  • 1998年,《中华风湿病学杂志》社被共青团省委、山...,1999年获山西省第二届书刊装帧艺术作品一等奖,1999—2002年被评为山西省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16745