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多房棘球绦虫95抗原T-B联合表位分析
  • ISSN号:1673-5234
  • 期刊名称:中国病原生物学杂志
  • 时间:2012.10.10
  • 页码:770-773
  • 分类:R383.23[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]新疆医科大学第一附属医院新疆包虫病vIP实验室,新疆乌鲁木齐830011, [2]新疆医科大学基础医学院
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30901374,31000411,81160378,81060135,30560146,30860263); 新疆自治区高校科研计划项目(No.XJEDU2010S25); 新疆医科大学研究生创新基金项目(No.MC2010-10)
  • 相关项目:细粒棘球绦虫BCG-egG1Y162重组疫苗的构建和保护机制研究
中文摘要:

目的应用相关软件和在线网络分析Em95的蛋白二级结构,预测B细胞表位和T细胞表位的联合表位。方法采用DNAStar软件和在线网络IEDB、SYFPEITHI及Propred等对Em95的B细胞表位和T细胞表位进行预测,寻找B细胞和T细胞表位共同的区域。结果 Em95存在潜在的抗原表位,其中B细胞表位区域为10-19、43-48、52-59、78-82、92-100和110-115;分值高的T细胞表位区域为32-40、51-60、82-98、108-116和126-138。B细胞和T细胞共同的表位区域为52-59、92-98和110-115。结论运用生物信息学方法确定Em95的3个T-B细胞联合表位存在于5个T细胞抗原表位和6个B细胞抗原表位中存在区域,对进一步研究Em95的抗原性和研发优势表位疫苗具有重要意义。

英文摘要:

Objective In order to predict combined B-and T-cell epitopes,the protein secondary structure of the Em95 antigen was analyzed using related software and the Internet.Methods To look for the common regions of B-and T-cell epitopes of Em9,the B-and T-cell epitopes of Em95 were predicted using DNAStar and IEDB,SYFPEITHI,and Propred online.Results Em95 has many latent antigenic epitopes.The possible B cell epitopes of Em95 are in the regions of 10-19,43-48,52-59,78-82,92-100,and 110-115.High-scoring T-cell epitopes are in the regions of 32-40,51-60,82-98,108-116,and 126-138.The common regions of B-and T-cell epitopes of Em95 are 52-59,92-98,and 110-115.Conclusion Bioinformatics indicated that there are three combined B-and T-cell epitopes in Em95,with 6 B-cell antigenic epitopes and 5 T-cell antigenic epitopes.These results are vital to further research on the antigenic characteristics and development of vaccines containing the dominant epitopes of Em95.

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期刊信息
  • 《中国病原生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 卫生部疾病控制司 山东省寄生虫病防治研究所
  • 主编:庄辉
  • 地址:山东省济宁市太白楼中路11号
  • 邮编:272033
  • 邮箱:www.cjpb.org
  • 电话:0537-2342934
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5234
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5457/R
  • 邮发代号:24-81
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会、系列杂志优秀期刊,山东省优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8395