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疣粒野生稻半胱氨酸蛋白酶基因ME085的cDNA全长克隆及序列分析
  • ISSN号:1004-1389
  • 期刊名称:《西北农业学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511.9[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]云南农业大学农学与生物技术学院,昆明650000, [2]云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,昆明650000, [3]云南省农业生物技术重点实验室,昆明650000, [4]云南昆明农业部西南作物资源与新种质创制重点实验室,昆明650000
  • 相关基金:国家自然科学基金(31000746,31160067);公益性行业专项(201003021);云南省科技项目(2010CD098,2012CH010)云南高端人才引进项目(2010C1120).
中文摘要:

为了发掘疣粒野生稻抗性基因,从受白叶枯菌诱导的疣粒野生稻叶片抑制差减文库(SSH文库)中选择抗病相关的EST序列,运用cDNA末端快速扩增法(RACE)获得一个基因全长,命名为ME085。通过生物信息学分析表明该基因全长1171bp,具有一个750bp的开放阅读框,编码249个氨基酸,其理论等电点为5.76,相对分子质量为27580.1,存在一个明显的半胱氨酸蛋白酶结构域。推测该基因是一个半胱氨酸蛋白酶基因。

英文摘要:

In order to finding the resistance genes of Oryza meyeriana, the EST related to disease resistance was selected from subtraction cDNA library of Oryza rneyeriana induced by Xanthomonas carnpestris pv. oryzae. Based on the EST, we obtained a full length of cDNA and named ME085 by rapidly amplification cDNA ends. Bioinformatic analysis showed the gene sequence was 1 171 bp including 750 bp of open reading frame(ORF) which encoding a protein of 249 amino acids with a predicted relative molecular mass of 27 580.1 and a hypothetical pI(isoelectric point) of 5.76. Meanwhile, there is an obvious domain of Cysteine protease. Therefore, ME085 is deduced as a Cysteine protease gene.

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期刊信息
  • 《西北农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 甘肃、宁夏、青海、新疆农(林)业科学院 青海、新疆畜牧(兽医)科学院及新疆农垦科学院
  • 主编:廖允成
  • 地址:陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学西林校区大铁10号信箱
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbnx@chinajournal.net.cn
  • 电话:029-87082760 87082010
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-1389
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1220/S
  • 邮发代号:52-111
  • 获奖情况:
  • 教育部科技司颁发的"优秀科技期刊二等奖"等
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:27312