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葡萄抗霜霉病基因同源序列的克隆与分析
  • ISSN号:1000-1700
  • 期刊名称:《沈阳农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S663.1[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161, [2]辽宁省农业科学院植物保护研究所,沈阳110161
  • 相关基金:基金项目:公益性行业(农业)科研专项项目(201203035)
中文摘要:

依据抗病基斟在保守区域序列同源的原理,针对已知抗病基因NBS保守结构区域设计9条简并引物,以高抗霜碡病的葡萄品种贝达为材料,人工接种葡萄霜霉病菌15d后,应用PCR技术从叶片cDNA中分离出2条抗霜霉病基因同源序列VR5和VRl6,并提交到Genbank,其中VR5含有507bp,登录编号为JQ763391;VRl6含有562bp,登陆编号为JQ763392。2条序列均含有P-环(GGVGKTr)、kinase。(VLDD)、kinase。(GSRII)及HD(即GLPL)等植物抗病基因中的保守结构。聚类分析结果表明,VR5与亚麻抗病基因,J6聚为一类,VRl6与拟南芥抗病基因RPS2聚为一类,编码氨基酸序列同源性分别为38%$N56%。

英文摘要:

Based on the NBS conserved sequences of known resistance genes, nine degenerated primers were designed to be used for amplifying grape downy mildew resistance gene analogs (RGAs). In this study, 2 RGAs, were obtained from eDNA in Beta grape (high resisitance to downy mildew) that had been infected by downy mildew for 15 days and registered in the Genebank, VR5 (Accession number: JQ763391) has 507bp and VR]6 (Accession number:JQ763392) has 562bp. Sequence analysis indicated that the two cloned RGAs both have four motifs of NBS conserved regions, including P-Ioop(GGVGKTF), kinase-Z(VLDD), kinase-3(GSRII) and membrane spanning region(GLPL). Cluster analysis results showed that VR5 and VRI6 were grouped with L6 (disease resistance gene in Linum) and RPS2 (disease resistance gene in A rabidopsis), the amino acid sequence homology was 38% and 56%, respectively.

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期刊信息
  • 《沈阳农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:沈阳农业大学
  • 主编:李天来
  • 地址:沈阳市东陵路120号
  • 邮编:110161
  • 邮箱:syndxb@126.com
  • 电话:024-88487082 88487083
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1700
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1134/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18397