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低温胁迫响应的甜杨miR475靶基因的预测及表达
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]北京林业大学生物科学与技术学院,林木育种国家工程实验室,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京100083
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(J1103516)资助
中文摘要:

MicroRNAs(miRNAs)通过使靶mRNA降解或翻译参与生物体的转录后调控,并在植物对生物与非生物胁迫的应答过程中发挥重要作用。本研究基于相关数据库,利用生物信息学方法,通过搜索预测及实验验证得到甜杨(Populus suaveolens)低温响应miR475的12条潜在靶基因,并对其降解位点进行分析;同时,以低温(0℃)处理不同时间甜杨幼苗为试材,利用荧光定量PCR对miR475及其靶基因的表达谱进行检测分析,结果发现,随着低温诱导时间的延长,miR475表达量呈下调趋势,而其靶mRNA的表达量则呈现相反趋势,表明甜杨miR475可能以降解靶mRNA的方式在抵御低温中发挥作用。本文研究结果可为甜杨抗冻机制的后续深入研究提供科学依据。

英文摘要:

The miRNA participates in posttranscriptional regulation by regulating degradation or translation of target mRNAs, and plays a key roles in response of plants to biotic and abiotic stresses. In this paper, based on the database of mRNA and EST of poplar, the 12 potential target genes of cold-related miR475 were predicted by using bioinformatics and verified in Populus suaveolens, and the cleavage sites of the miRNA target genes were analyzed. In addition, the expression profiles of the obtained target mRNAs and mature miRNA from P. suaveolens seedlings exposed to 0℃ for 0 to 48 hours were analyzed by quantitative realtime PCR.The results reveal that the expression of miR475 was down-regulated and its target mRNAs show the opposite trend, suggesting that miR475 may function in low temperature resistance by regulating degradation of the target mRNAs. The results would provide a theoretical basis to further explore of the molecular mechanism of cold resistance in P. suaveolens.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299