位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
滩羊FGF21基因CDS区克隆表达及生物信息学分析
  • ISSN号:0258-7033
  • 期刊名称:《中国畜牧杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S827.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业大学动物科技学院,北京100193, [2]宁夏大学农学院,宁夏银川750021
  • 相关基金:长江学者和创新团队发展计划(IRT1191);转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX08009-001)
中文摘要:

为了探究滩羊卷曲被毛时空变化特征,本研究运用基因克隆技术对滩羊FGF21基因的编码区全长序列进行克隆测序,利用生物信息学方法进行序列分析,并对FGF21基因在滩羊不同生长时期皮肤中的表达模式进行分析。结果表明:滩羊FGF21基因的CDS区有1个630 bp的开放阅读框,编码209个氨基酸,其编码蛋白分子量和理论等电点分别为22645.8 ku和6.08 ku,该蛋白不存在跨膜结构,为膜外蛋白,且属于亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋、延伸、β-折叠及无规则卷曲4种结构组成;滩羊FGF21基因序列与山羊、牛等物种间同源性较高,所构建系统发生树与其物种同源性关系吻合。半定量RT-PCR分析FGF21基因在滩羊不同组织中分布发现,FGF21仅在肝脏、肺脏、胃和皮肤中表达,在皮肤中表达量低于在肝脏中的表达量,但高于在胃中的表达量;不同时期滩羊皮肤组织荧光定量PCR结果显示,FGF21基因在幼龄组(1月龄)滩羊皮肤中表达量极显著高于成年组(48月龄)表达量(P〈0.01),表明FGF21基因有可能是调控滩羊皮肤被毛卷曲差异的候选基因之一。本研究将为滩羊毛发生长的生物学机制研究提供一定的参考价值。

英文摘要:

This study aimed to elucidate the structure, physiological function and the expression levels of FGF21 gene on Tan sheep. The FGF21 gene of Tan sheep was amplified through PCR using extracted RNA from skin samples Then the gene was sequenced and analyzed by bioinformatics tools. The CDS region length of cloned Tan sheep FGF21 gene was 630bp encoded 209 amino acids with a molecular mass of 22645.8 Da. The secondary of the protein were mainly composed of α-helix, β-turn, extended strand structure and random coll. Phylogenetic tree and sequence alignment showed the FGF21 gene of Tan sheep had a high homology with other species in nucleotide sequence and the gene was relatively conservation. Semi-quantitative RT-PCR analysis showedthat FGF21 gene only expressedin liver, lung, skin and stomach, but higher in liver, then in lungs and skin, lower in stomach. Further q-PCR data from skin showed that the expression of FGF21 gene at one-month-old was significantly higher than (P〈0.01) that at 48-month-old. All the results suggest that FGF21 gene may play an important role in curly fleece formationmechanism in Chinese Tan sheep, and supply some value clues for further research on biology characterization of curly fleece growth.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国畜牧杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:呙于明
  • 地址:北京海淀区上地信息路1号B栋727室
  • 邮编:100085
  • 邮箱:zgxmzz@cau.edu.cn
  • 电话:010-82893431
  • 国际标准刊号:ISSN:0258-7033
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2083/S
  • 邮发代号:82-147
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20639