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小菜蛾ISSR-PCR反应体系的建立与正交设计优化
  • ISSN号:0529-1542
  • 期刊名称:植物保护
  • 时间:2012
  • 页码:90-94
  • 分类:S433.4[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]东北农业大学生命科学学院,哈尔滨150030, [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项(201103021);国家科技支撑计划(2012BADl9806);国家自然科学基金(31071709)
  • 相关项目:阿维菌素抗性小菜蛾GABA和GluCl受体基因功能的RNAi研究
中文摘要:

以小菜蛾(Plutella xylostella)基因组DNA为模板,采用L16(45)正交试验设计方法,建立小菜蛾的ISSR最佳反应体系。通过梯度退火试验,确定不同引物的最适退火温度。优化得到的反应体系(20μL)为:Mg2+浓度1.5mmol/L、Taq DNA聚合酶2.5U、dNTPs浓度0.2mmol/L、引物浓度1.25μmol/L、模板DNA量20ng。反应程序为:94℃预变性5.0min;94℃变性45.0s,40~61℃(不同引物退火温度各异)退火1.0min,72℃延伸1.5min,40个循环;72℃延伸10.0min;10℃保存。利用所建立的ISSR-PCR反应体系,获得了清晰、重复性好的DNA谱带。

英文摘要:

To establish and optimize ISSR-PCR reaction system for Plutella xylostella, based on the genomic DNA of P. xylostella, the factors influencing ISSR system were explored with the L16 (45 ) orthogonal design. The optimal annealing temperature for ISSR-PCR reaction was proposed by gradient PCR. The optimal conditions for ISSR reaction system (20 μL) were determined as follows: 1.5 mmol/L of Mg2+ , 2.5U of Taq DNA polymerase, 0.2 mmol/L of dNTPs mixture, 1.25 μmol/L of each primer, and 20ng of template DNA. The reaction program was as followed: initial denaturation for 5.0 min at 94 ℃, 35 cycles of denaturation for 45s at 94 ℃, annealing for 1.0 min at 40--61 ℃, extension for 1.5 min at 72 ℃, with a final extension of 10.0 min at 72 ℃. The clear and reproducible DNA bands were obtained by the established ISSR-PCR reaction system.

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期刊信息
  • 《植物保护》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国植物保护学会 中国农业科学院植物保护研究所
  • 主编:陈万权
  • 地址:北京圆明园西路2号中国农业科学院植物保护研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zwbh1963@263.net
  • 电话:010-62819059
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-1542
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1982/S
  • 邮发代号:2-483
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖提名奖(科技类),全国优秀科技期刊奖,中国科协优秀学术期刊奖,全国农业科技优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国农业科学院优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21665