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基于强阳离子交换色谱分离的磷酸化肽段富集策略
  • ISSN号:1000-8713
  • 期刊名称:《色谱》
  • 时间:0
  • 分类:O658[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京102206, [2]防化指挥工程学院,北京102205
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(Nos.20405017,20505018,20505019,20635010)和国家重点基础研究发展计划(“973”)项目(2004CB518707,2006CB910801,2006CB910803,2007CB714104).
中文摘要:

为了在短时间内获得相对含量高的磷酸化肽段,以标准磷酸化蛋白质为模型对强阳离子交换色谱(SCX)分离磷酸化肽段体系的缓冲溶液和梯度设置进行了研究,并用酵母酶切肽段混合物考察了该路线在较复杂的样品中的应用。实验结果表明优化后的体系能够在30min内分离出磷酸肽段,而且非磷酸化肽段的干扰很少,这样便相对提高了磷酸化肽段在质谱仪中的响应强度,重要的是该体系可以对复杂样品进行很好的分离。这说明SCX用于规模化磷酸化肽段富集的策略是可行的。本研究为磷酸化蛋白质组学规模化分析提供了实用技术。

英文摘要:

The routine analysis of phosphoproteomics needs effective and specific enrichment methods.The strong cation exchange chromatography(SCX)separation conditions,including the buffer solution and the separation gradient,were studied to enrich the phosphopeptides in a short time.Firstly,the tryptic peptides of standard protein mixtures(bovine α-casein and β-casein,chicken egg ovalbumin)were used to optimize the SCX strategy.Then,this method was applied to the complicated samples,the tryptic peptides from yeast.The experimental results showed that the phosphopeptides were eluted before 30 min in the optimized SCX systems with less interference from nonphosphopeptides.Phosphopeptides were successfully separated in a short time,and the ion signals corresponding to phosphopeptides were accordingly increased during mass spectrometric analysis.It was indicated that the optimized SCX separation system could be used as a simple enrichment method for the separation of phosphopeptides,especially for phosphopeptides in the complex real samples,in a short time,and to increase the relative abundance of phosphopeptides in the detection fraction.This study provides the pragmatic technique for phosphoproteomics analysis on a large-scale.

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期刊信息
  • 《色谱》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院大连化学物理研究所
  • 主编:张玉奎
  • 地址:大连市中山路457号
  • 邮编:116023
  • 邮箱:sepu@dicp.ac.cn
  • 电话:0411-84379021
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8713
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1185/O6
  • 邮发代号:8-43
  • 获奖情况:
  • 1998年获中国科学院科学出版基金择优支持(1998-2...,2001年获第四届中国科学院优秀期刊二等奖,2002年获第三届中国科协优秀期刊三等奖,连续多年被评为辽宁省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26730