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磺化修饰结合离子交换色谱和生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段
  • ISSN号:1000-8713
  • 期刊名称:《色谱》
  • 时间:0
  • 分类:O658[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]北京理工大学,北京100081, [2]北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京放射与辐射医学研究所,北京102206
  • 相关基金:国家自然科学基金课题(No.20505018,20635010,20735005,20875101)和国家重点基础研究发展规划项目(No.2007CB914104,2006AA02A308).
中文摘要:

通过在肽段的N端引入磺酸基,从而使含组氨酸的肽段与其他肽段在pH〈3.0的条件下产生电荷差异,建立了一种基于强阳离子交换色谱(SCX)结合生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段的方法,并以含有组氨酸的标准蛋白质为模型,进行了方法学考察。结果表明,经N端磺酸化后,含组氨酸的肽段能有效地被阳离子交换色谱富集,且在肽的N端引入磺酸基促进了肽的裂解,使之产生简单而信息丰富的二级质谱图,从而得到完美的质谱鉴定结果。这说明磺化修饰结合强阳离子交换色谱用于含组氨酸肽段的富集鉴定是可行的,且具有在蛋白质组研究中应用的潜力。

英文摘要:

By the sulfonation at the N-terminal of peptides,the charge state of histidine-containing peptides is different from that of other peptides in pH〈3.0 solution.Based on this difference,a new method was developed to isolate and identify sulfonated histidine-containing peptides from tryptic digest of proteins by strong cation exchange(SCX) chromatography and matrix-assisted laser desorption/ionization tandem time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS/MS).Using the standard proteins containing histidines as the model,the methodology was evaluated.The results show that sulfonated histidine-containing peptides were efficiently enriched by SCX,and the N-terminal sulfonation of the peptides simplifies the interpretation of the acquired mass spectra and facilitates the sequencing of histidine-containing peptides by producing consecutive and predominant ions in positive mode MS2 spectra,which is thought to be the result of the charge neutralization of b ions by the N-terminal sulfonic acid group.The discrimination of b ions and y ions can greatly enhance the confidence in peptide and subsequent protein identification.It is feasible to isolate and enrich the histidine-containing peptides by using this method which has the potential applications in proteomics.

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期刊信息
  • 《色谱》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院大连化学物理研究所
  • 主编:张玉奎
  • 地址:大连市中山路457号
  • 邮编:116023
  • 邮箱:sepu@dicp.ac.cn
  • 电话:0411-84379021
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8713
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1185/O6
  • 邮发代号:8-43
  • 获奖情况:
  • 1998年获中国科学院科学出版基金择优支持(1998-2...,2001年获第四届中国科学院优秀期刊二等奖,2002年获第三届中国科协优秀期刊三等奖,连续多年被评为辽宁省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26730