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蛋白质组学质谱平台肽段可检测性预测研究进展
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:O655[理学—分析化学;理学—化学] Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]国防科学技术大学机电工程与自动化学院,长沙410073, [2]蛋白质组学国家重点实验室,北京蛋白质组研究中心,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京100850
  • 相关基金:本文系国家重点基础研究发展计划(973)(Nos.2006CB910803,2006CB910706,2010CB912700)、国家高技术研究发展计划(863)(No.2006AA02A312)、国家科技重大专项(Nos.2008ZX10002-016,2009ZX09301-002)、国家自然科学基金(Nos.30800200,30621063)和蛋白质组学国家重点实验室课题(No.SKLP-Y200811)资助
中文摘要:

生物质谱是蛋白质组研究中的核心技术之一,可以实现大规模、高通量的蛋白质定性和定量分析。由于样品和实验过程自身的复杂性,质谱实验的重复性还存在一些问题,肽段鉴定和定量结果有很大的随机性,肽段的质谱检测概率问题在蛋白质组研究中,特别是定量蛋白质组研究中备受关注。本文总结了影响肽段可检测性的重要因素,分析了已经提出的计算预测方法,并对其在实验研究中的应用进行了综述。

英文摘要:

As the complexity of samples and experimental processes,the repeatability of mass spectrometry experiments is still not satisfactory,the results of peptide identification and quantification show high randomicity,the probability of peptide being detected by mass spectrometry in proteome research,especially in quantitative proteomic study,has received much attention.Therefore,a lot of experimental researches have been done,as well as a number of computational prediction methods have been developed.In this article,we summarized the important factors impacting the peptide detectability,investigated the existing prediction methods and reviewed their applications in experimental study.

同期刊论文项目
期刊论文 96 会议论文 34 获奖 10 著作 4
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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455