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求解MSA问题的新型单亲遗传算法
  • ISSN号：1002-8331
  • 期刊名称：《计算机工程与应用》
  • 时间：0
  • 分类：TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构：[1]华南理工大学计算机科学与工程学院，广州510640
  • 相关基金：国家自然科学基金资助(编号:30230350)
作者： 胡桂武[1], 郑启伦[1], 彭宏[1]
关键词： MSA, 单亲遗传算法, 生物信息学, 算子
中文摘要：

多序列联配(MA)在生物信息学研究中占有重要地位，MSA问题是一个典型的NP问题，遗传算法是求解NP完全问题的一种理想方法。文章针对MSA问题。提出了一种新型单亲遗传算法(PGA），不使用交叉算子，只使用变异和选择算子。并根据群体的多样性自适应调节变异概率，有效消除了算法中的欺骗性条件，使用灾变算子来确保算法的搜索能力。整个算法模拟了自然界进化的周期性，较好地解决了群体的多样性和收敛深度的矛盾。算法的分析和测试表明，该算法是有效的。

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊（2014版）
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编：怀进鹏
  • 地址：北京市海淀区北四环中路211号北京619信箱26分箱
  • 邮编：100083
  • 邮箱：ceaj@vip.163.com
  • 电话：
  • 国际标准刊号：ISSN：1002-8331
  • 国内统一刊号：ISSN：11-2127/TP
  • 邮发代号:82-605
  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:97887