随着我国金融市场的不断开放,商业银行面临的竞争压力不断加剧,而效率是影响商业银行生死存亡的重要因素。本文基于所有制结构分析角度,运用超效率DEA模型对我国4家国有商业银行和9家股份制商业银行2006年至2010年的成本效率进行了研究,并将成本效率进一步分解为技术效率和配置效率进行了比较分析。实证分析结果表明:我国商业银行成本效率总体呈上升趋势:不同所有制结构的银行中,国有商业银行技术效率高于股份制商业银行,而配置效率低于股份制商业银行。本文提出可从优化产权结构、提高资产质量、加大金融产品创新力度方面提高成本效率的对策建议。