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柞蚕微孢子核糖体基因和转录间隔区的序列及系统进化分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S682.31[农业科学—观赏园艺;农业科学—园艺学] X703.1[环境科学与工程—环境工程]
  • 作者机构:[1]江苏大学生命科学研究院,镇江212013
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(“973”计划,2005CB121000);江苏省“333”人才基金项目.
中文摘要:

【目的】研究柞蚕微孢子(Nosema antheraeae)的核糖体基因,转录间隔区(ITS)以及它们的排列顺序,为柞蚕微孢子的分类和系统进化分析提供分子生物学方面的依据。【方法】采用特异gl物进行PCR扩增,克隆和测序。用DNAStar软件,用Clustalw的比对方法得到遗传距离和系统进化树。【结果】得到柞蚕微孢子的核糖体小亚基rRNA(SSUrRNA),转录间隔区(ITS),5SrRNA的全长,得到核糖体大亚基rRNA(LSUrRNA)的部分序列。【结论】柞蚕微孢子的核糖体基因排列顺序为LSU-ITS1-SSU—ITS2-5s与Nosema bombycis相同,是一种比较特殊的排列方式。将微孢子SSU rRNA基因和ITS结合起来分析微孢子的亲缘关系是一个新的尝试。

英文摘要:

[Objective] This paper examines the sequence and organization of the ribosomal RNA gene, the ITS region of Nosema antheraeae, and present molecular biological evidence of Nosema antheraeae taxonomy. [Method ] To obtain the phlogenetic tree and sequence distance, specific primers were used for PCR amplification, then clone and nucleotide sequences were aligned using Clustal W ofDNAStar sotiware. [Result] The outcome entailed a full small subunit rRNAs (SSU rRNA) gene, the internal transcribed spacer (ITS), 5S rRNA gene and part of the large subunit rRNAs (LSU rRNA) gene of Nosema antheraeae. [Conclusion] The organization of the ribosomal RNA gene of Nosema antheraeae follows a special organizational pattern: LSU-ITS1-SSU-ITS2-5S. Elucidating phylogenetic relationships of microsporidia species by combining information from SSU rRNA and ITS sequence is a new experiment.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620